45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0231 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0231  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12557  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  35.71 
 
 		 180 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4240  hypothetical protein  35.52 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  33.15 
 
 		 181 aa  98.6  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  31.15 
 
 		 181 aa  98.2  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  32.4 
 
 		 178 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  33.15 
 
 		 181 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  32.64 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0252  hypothetical protein  35.56 
 
 		 183 aa  95.1  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  31.28 
 
 		 181 aa  94.7  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  34.24 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04007  hypothetical protein  31.4 
 
 		 167 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3522  hypothetical protein  31.82 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  32.42 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  32.42 
 
 		 181 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  31.87 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  31.87 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  30.49 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  30 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  26.2 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  28.5 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  26.2 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0108  hypothetical protein  26.34 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985875  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0123  hypothetical protein  25.74 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.0223002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0125  hypothetical protein  25.85 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2712  transmembrane cytochrome oxidase associated protein  32.02 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0477  hypothetical protein  32.47 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  28.72 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  27.23 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0128  hypothetical protein  25 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  25 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0453  hypothetical protein  31.82 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00960  hypothetical protein  26.55 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  28.14 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  25.58 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  26.44 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  21.9 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  21.24 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  23.33 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  23.04 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  23.33 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  24.75 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  23 
 
 		 210 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>