279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1838 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1838  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 99 aa  201  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000383843  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  47.19 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0491  50S ribosomal protein L23  39.81 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.98557  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  39.58 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  44.09 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  42.27 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  44.32 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  41.05 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  40.21 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  38.14 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  42.27 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  36.36 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  44.33 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  42.05 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  41.94 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2421  50S ribosomal protein L23  40.82 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  41.84 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2062  50S ribosomal protein L23  40.82 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000372125  normal  0.225776 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  41.84 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  37.89 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  37.89 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  0.00000000336824 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  35.87 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  38.04 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0962  50S ribosomal protein L23  36.84 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000402083  hitchhiker  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0423  50S ribosomal protein L23P  35.11 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0123777  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  33 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  32.99 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  37.76 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  36.46 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  39.8 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  34.69 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  33 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  32.65 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  32.65 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_002950  PG1936  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0844  Ribosomal protein L25/L23  39.78 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  34.04 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  32.65 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  40.43 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  32.65 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  39.8 
 
 		 95 aa  52.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  34.04 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  35.11 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  35.11 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0456  50S ribosomal protein L23  35.05 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0420406  unclonable  0.000000164588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4747  50S ribosomal protein L23  35.05 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000334762  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  37.37 
 
 		 94 aa  52  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  36.96 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  37.89 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 		 101 aa  52  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0489  50S ribosomal protein L23  35.05 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000019112  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0486  50S ribosomal protein L23  35.05 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0496  50S ribosomal protein L23  34.69 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000003402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06270  50S ribosomal protein L23  32.29 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  37.76 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0182  50S ribosomal protein L23  38.83 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000184382  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  35.79 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  39.58 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0435  50S ribosomal protein L23  35.71 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00486251  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  40.21 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  36.84 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00447  50S ribosomal protein L23  46.27 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000740057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  34.95 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  34.74 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  34.38 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  41.98 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  37.78 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  35.42 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  34.78 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  35.87 
 
 		 98 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0471  50S ribosomal protein L23  36.84 
 
 		 100 aa  50.8  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000395002  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  36.84 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  35.87 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  35.92 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  32.99 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  32.99 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  33.67 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  31.96 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  29.47 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  36.08 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2772  50S ribosomal protein L23  30.93 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0118683  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  30.21 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0339  50S ribosomal protein L23  34.38 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000150967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  32.29 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1849  50S ribosomal protein L23  40.21 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.310449  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  38.71 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  35.11 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0061  50S ribosomal protein L23  37.93 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000105028  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  35.96 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  35.56 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  36.63 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1852  50S ribosomal protein L23  34.38 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000651916  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  32.99 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>