More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5041 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7202  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  74.12 
 
 		 425 aa  678    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303573 
 
 
-
 
NC_004310  BR0245  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  76 
 
 		 425 aa  693    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0878  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  75.76 
 
 		 426 aa  681    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0238  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  75.76 
 
 		 451 aa  689    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.866723  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  84.74 
 
 		 426 aa  761    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.963683  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0622  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  96.71 
 
 		 425 aa  845    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2410  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  76.18 
 
 		 425 aa  700    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6044  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  74.06 
 
 		 425 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3134  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  78.82 
 
 		 427 aa  721    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.174435  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5129  hypothetical protein  73.52 
 
 		 429 aa  674    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0640  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  79.06 
 
 		 425 aa  710    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.106919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3597  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  92.94 
 
 		 425 aa  818    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3391  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  74.47 
 
 		 425 aa  658    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3326  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  100 
 
 		 425 aa  870    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305234  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1697  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  76.18 
 
 		 425 aa  700    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0225927 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4969  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  96 
 
 		 425 aa  843    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4969  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  75.06 
 
 		 425 aa  682    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428522  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4449  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  96.24 
 
 		 425 aa  843    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.148415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5243  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  99.76 
 
 		 425 aa  868    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5041  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 425 aa  870    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.395337 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  74.59 
 
 		 425 aa  686    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2508  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  76.18 
 
 		 425 aa  700    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1084  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  77 
 
 		 426 aa  704    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214438  normal  0.210601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2553  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  67.31 
 
 		 434 aa  595  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00423764  normal  0.461549 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1189  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.39 
 
 		 431 aa  585  1e-166  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.73287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2815  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  66.34 
 
 		 436 aa  587  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0267  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.9 
 
 		 442 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3515  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  64.93 
 
 		 433 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000711925  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1347  putative mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  64.62 
 
 		 432 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4173  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.92 
 
 		 432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161442  hitchhiker  0.000391441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3012  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  63.57 
 
 		 435 aa  570  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5599  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.68 
 
 		 432 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2951  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  62.47 
 
 		 437 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.364706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2858  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  62 
 
 		 437 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4070  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  62.36 
 
 		 453 aa  542  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1748  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  59.76 
 
 		 438 aa  544  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2104  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  59.72 
 
 		 431 aa  541  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.429752  normal  0.478191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8215  phosphopyruvate hydratase  60.95 
 
 		 431 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2831  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  61.9 
 
 		 411 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1458  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  62.26 
 
 		 437 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.43864 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06035  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09810)  59.57 
 
 		 451 aa  527  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5057  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  59.43 
 
 		 431 aa  526  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4193  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  60.24 
 
 		 453 aa  521  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.942147  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0394  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  60.96 
 
 		 470 aa  522  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0760  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  59.33 
 
 		 435 aa  524  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03266  RTS beta protein  58.49 
 
 		 439 aa  501  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4921  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.19 
 
 		 444 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01020  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, putative  54.1 
 
 		 472 aa  499  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.629016  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0366  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  56.97 
 
 		 440 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00640  L-fuconate dehydratase  57.45 
 
 		 442 aa  482  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0234  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.08 
 
 		 448 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1860  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.45 
 
 		 408 aa  354  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2117  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.53 
 
 		 413 aa  323  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0313  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.42 
 
 		 371 aa  133  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3550  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.94 
 
 		 376 aa  133  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0951632  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0239  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.44 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0232  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.44 
 
 		 372 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3962  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.33 
 
 		 370 aa  126  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3561  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.97 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4975  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.08 
 
 		 370 aa  123  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0890752 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0918  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.31 
 
 		 398 aa  122  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4022  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.11 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3977  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.11 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.618282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3915  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.11 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4083  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.11 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.386649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3386  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.99 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4435  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.78 
 
 		 377 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0118641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2271  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.98 
 
 		 369 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.897407  normal  0.90491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2405  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.41 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.44174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2476  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.53 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2394  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.83 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3395  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.7 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1717  putative racemase  36.51 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.640537  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0822  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.18 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0032  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.88 
 
 		 375 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2648  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  28.05 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000278082  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.72 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.08 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2550  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.39 
 
 		 378 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000249838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4708  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.35 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0028  putative mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  26.78 
 
 		 362 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370595  normal  0.102793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1050  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.45 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0466  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.53 
 
 		 377 aa  106  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0038  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.92 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0470  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.73 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2021  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.83 
 
 		 362 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0799  mandelate racemase  28.61 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934998  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3336  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.68 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7246  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.95 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000177277  normal  0.41126 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.37 
 
 		 382 aa  99.8  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1946  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.67 
 
 		 378 aa  99.8  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0864  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.25 
 
 		 373 aa  99.4  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3056  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.49 
 
 		 390 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4042  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.54 
 
 		 379 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0785  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.4 
 
 		 366 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244096  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0947  mandelate racemase  30.4 
 
 		 366 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215309  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3211  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.55 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3370  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.45 
 
 		 389 aa  98.2  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.90513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0773  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.89 
 
 		 366 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5071  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.8 
 
 		 390 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>