More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5599 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2831  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  73.65 
 
 
411 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236635  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2858  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  74.3 
 
 
437 aa  674    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0267  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  68.84 
 
 
442 aa  637    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3515  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  81.4 
 
 
433 aa  745    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000711925  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1347  putative mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  90.74 
 
 
432 aa  823    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1748  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  75.23 
 
 
438 aa  684    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4173  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  90.95 
 
 
432 aa  818    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161442  hitchhiker  0.000391441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2951  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  74.07 
 
 
437 aa  675    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.364706  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2815  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  70.86 
 
 
436 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143363  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3012  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  69.09 
 
 
435 aa  642    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5599  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
432 aa  897    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2553  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  70.86 
 
 
434 aa  647    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00423764  normal  0.461549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2104  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  65.42 
 
 
431 aa  598  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.429752  normal  0.478191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0640  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.39 
 
 
425 aa  579  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.106919  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1189  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.4 
 
 
431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.73287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1084  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.3 
 
 
426 aa  573  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214438  normal  0.210601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2410  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  61.32 
 
 
425 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1697  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  61.32 
 
 
425 aa  569  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0225927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2508  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.32 
 
 
425 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5243  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.92 
 
 
425 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0878  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.44 
 
 
426 aa  567  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0622  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.39 
 
 
425 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3326  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  63.68 
 
 
425 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305234  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4969  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.15 
 
 
425 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4449  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.15 
 
 
425 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.148415 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5041  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.68 
 
 
425 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.395337 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3597  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  62.97 
 
 
425 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  62.35 
 
 
426 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.963683  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3134  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  62.74 
 
 
427 aa  555  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.174435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.08 
 
 
425 aa  545  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5129  hypothetical protein  60.61 
 
 
429 aa  545  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296521  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3391  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  60.42 
 
 
425 aa  542  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_004310  BR0245  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  60.14 
 
 
425 aa  535  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4969  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  60.38 
 
 
425 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428522  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6044  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  60.14 
 
 
425 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4193  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.31 
 
 
453 aa  533  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.942147  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8215  phosphopyruvate hydratase  59.11 
 
 
431 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7202  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  60.14 
 
 
425 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303573 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0238  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  59.91 
 
 
451 aa  532  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.866723  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06035  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09810)  59.09 
 
 
451 aa  526  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5057  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.87 
 
 
431 aa  526  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0760  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.67 
 
 
435 aa  519  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01020  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, putative  55.92 
 
 
472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.629016  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4070  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.47 
 
 
453 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1458  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.08 
 
 
437 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.43864 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03266  RTS beta protein  55.58 
 
 
439 aa  508  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4921  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.14 
 
 
444 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0394  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.13 
 
 
470 aa  497  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0234  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.09 
 
 
448 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00640  L-fuconate dehydratase  51.52 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0366  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  53.01 
 
 
440 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1860  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.72 
 
 
408 aa  360  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2117  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.82 
 
 
413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0313  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.5 
 
 
371 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4975  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.99 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0890752 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0232  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.62 
 
 
372 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3550  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.84 
 
 
376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0951632  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0239  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.38 
 
 
372 aa  130  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3962  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.5 
 
 
370 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3395  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.42 
 
 
369 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2394  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4435  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.82 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0118641  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  34.18 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.31 
 
 
390 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.601828  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0038  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.88 
 
 
375 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0032  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.37 
 
 
375 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2271  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.7 
 
 
369 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.897407  normal  0.90491 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0864  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.14 
 
 
373 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5455  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.67 
 
 
369 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3195  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.24 
 
 
390 aa  106  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.75 
 
 
384 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0918  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.45 
 
 
398 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0028  putative mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  26.11 
 
 
362 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370595  normal  0.102793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4290  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.08 
 
 
385 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0251584  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3915  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.86 
 
 
398 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4022  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.86 
 
 
398 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3977  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.86 
 
 
398 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.618282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4083  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.86 
 
 
398 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.386649  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3386  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.56 
 
 
398 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3874  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.93 
 
 
401 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0228827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2476  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.22 
 
 
398 aa  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4374  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.17 
 
 
390 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1717  putative racemase  29.26 
 
 
359 aa  103  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.640537  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7246  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.17 
 
 
380 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000177277  normal  0.41126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2836  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  25 
 
 
390 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.182529  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4643  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.61 
 
 
421 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3561  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.5 
 
 
396 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3056  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.11 
 
 
390 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5055  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.52 
 
 
390 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.902489  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0466  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.71 
 
 
377 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5805  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.52 
 
 
390 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598482  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0947  mandelate racemase  32.08 
 
 
366 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0785  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.08 
 
 
366 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0773  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.08 
 
 
366 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0435  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.81 
 
 
383 aa  99.8  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00387295  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3074  hypothetical protein  27.45 
 
 
391 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36070  hypothetical protein  28.24 
 
 
391 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000846029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3211  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.19 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514043  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5071  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.5 
 
 
390 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435068  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.07 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>