More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0919 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2248  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0919  transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1005  transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492004  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1748  response regulator protein  84.18 
 
 		 153 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3756  winged helix family two component response transcriptional regulator  84.21 
 
 		 132 aa  202  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0860  response regulator receiver protein  84.21 
 
 		 132 aa  202  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4213  response regulator receiver protein  83.33 
 
 		 132 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4735  winged helix family two component response transcriptional regulator  83.33 
 
 		 132 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.511664 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5446  winged helix family two component response transcriptional regulator  82.46 
 
 		 132 aa  200  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.149365  normal  0.0360801 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3528  response regulator receiver protein  82.46 
 
 		 132 aa  200  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0103557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4838  response regulator receiver protein  82.46 
 
 		 132 aa  200  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0133671  decreased coverage  0.00111071 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1157  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0083  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  47.62 
 
 		 232 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 		 271 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 259 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.41 
 
 		 235 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  44.71 
 
 		 245 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.71 
 
 		 237 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.71 
 
 		 237 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.58 
 
 		 236 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  44.58 
 
 		 237 aa  85.1  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.11 
 
 		 237 aa  84.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 224 aa  84  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0484  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 254 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.81925 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2592  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 254 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0512  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 254 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0632255  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3599  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  36.84 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  37.08 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2886  two component transcriptional regulator  43.9 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541925  normal  0.0968864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  41.98 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  45.24 
 
 		 248 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  41.05 
 
 		 231 aa  77.4  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0416  two component transcriptional regulator  42.68 
 
 		 253 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 223 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  40.22 
 
 		 237 aa  77  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  37.08 
 
 		 228 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  44.44 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  44.44 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  39.78 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0442  two component transcriptional regulator  41.46 
 
 		 253 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.248748 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.79 
 
 		 245 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0943  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.58 
 
 		 235 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.58 
 
 		 235 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  34 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  41.11 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3520  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.130253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  35.05 
 
 		 296 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08380  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.96 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0276649  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 277 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  34.34 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  34.34 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  34.34 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1354  DNA-binding response regulator  35.78 
 
 		 260 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1557  DNA-binding response regulator  35.78 
 
 		 260 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1583  DNA-binding response regulator  35.78 
 
 		 260 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  36.56 
 
 		 234 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0833  DNA-binding response regulator  35.78 
 
 		 260 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  36.56 
 
 		 234 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1744  DNA-binding response regulator  35.78 
 
 		 260 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  34.34 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  34.34 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  41.98 
 
 		 236 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 237 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0520  DNA-binding response regulator  35.78 
 
 		 261 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0635  DNA-binding response regulator  35.78 
 
 		 260 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0959742  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  34.34 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  36.56 
 
 		 242 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  36.56 
 
 		 242 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 229 aa  70.9  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  36.56 
 
 		 242 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  32.35 
 
 		 241 aa  70.9  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 245 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  36.56 
 
 		 242 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  36.56 
 
 		 242 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  36.56 
 
 		 242 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 238 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  36.26 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  36.26 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  36.26 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  36.26 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  36.26 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 272 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  42.86 
 
 		 238 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  36.26 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  36.26 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>