More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0285 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0285  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
263 aa  518  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0261  ABC transporter, permease protein  99.24 
 
 
263 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.13 
 
 
262 aa  465  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.92 
 
 
259 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947992  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.12 
 
 
271 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.34 
 
 
260 aa  346  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324199  normal  0.863766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.68 
 
 
266 aa  345  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6067  ABC transporter permease  72.76 
 
 
261 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.64 
 
 
264 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.69 
 
 
274 aa  308  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2107  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.64 
 
 
265 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.48 
 
 
263 aa  301  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243564  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2355  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  59.92 
 
 
274 aa  298  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214574  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.71 
 
 
274 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.146122 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.04 
 
 
263 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1200  transmembrane permease ABC transporter protein  61.29 
 
 
263 aa  296  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.441856  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.04 
 
 
263 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3334  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  69.46 
 
 
265 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.227064  normal  0.190195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2103  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.71 
 
 
263 aa  295  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.02 
 
 
277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.58 
 
 
279 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3278  ABC transporter related protein  62.83 
 
 
257 aa  276  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000407876  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.97 
 
 
283 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.54 
 
 
276 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.54 
 
 
276 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.94 
 
 
268 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3330  ABC transporter membrane spanning protein  42.91 
 
 
295 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
293 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.877762  normal  0.739003 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7364 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 
295 aa  208  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.41 
 
 
295 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
302 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.033554  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0493  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  48.21 
 
 
287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114665  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.21 
 
 
287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753159  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.5 
 
 
294 aa  195  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0684117  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.98 
 
 
287 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0037  ABC transporter, permease protein  47.32 
 
 
259 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2678  ABC transporter, permease protein  46.88 
 
 
285 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.88 
 
 
285 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.090458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.88 
 
 
285 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0253  ABC transporter, permease protein  46.88 
 
 
282 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.735185  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2699  ABC transporter, permease protein  46.88 
 
 
282 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3274  ABC transporter, permease protein  46.88 
 
 
282 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1853  ABC transporter, permease protein  46.88 
 
 
282 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0040  ABC transporter, permease protein  46.88 
 
 
282 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0040  ABC transporter, permease protein  46.88 
 
 
282 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.522623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.88 
 
 
282 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.32 
 
 
285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.88 
 
 
282 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.05 
 
 
283 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3216  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  46.88 
 
 
285 aa  188  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.43 
 
 
285 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
329 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
280 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0794658  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
257 aa  136  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
271 aa  132  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
279 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 
292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.77 
 
 
261 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.83 
 
 
268 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.101401  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1306  ABC transporter, permease component  30.61 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.49 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 
277 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.18 
 
 
249 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.04587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  30.88 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  30.59 
 
 
282 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
273 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
257 aa  111  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  30.88 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  30.73 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  29.95 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  29.95 
 
 
250 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  29.95 
 
 
250 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
271 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  29.95 
 
 
250 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.97 
 
 
283 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  29.95 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  35.11 
 
 
279 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
253 aa  108  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
254 aa  108  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
258 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.16 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
269 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
243 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 
274 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.240571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.17 
 
 
266 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
251 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  31.45 
 
 
266 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  31.45 
 
 
266 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>