More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29160 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_29160  Response regulator, CheY-like protein  100 
 
 		 126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1981  response regulator receiver domain-containing protein  51.33 
 
 		 177 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2462  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 176 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3484  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180993  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2453  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2287  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0246688  normal  0.814678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6795  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.63 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3804  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 222 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.7 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48021  normal  0.282737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.04 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 250 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4329  two component transcriptional regulator  35.85 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.077082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0108  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 465 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000558041 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 657 aa  62.8  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2396  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  36.63 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2521  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 475 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0633509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.34 
 
 		 391 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1992  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 460 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2343  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 475 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1886  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.17 
 
 		 461 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1847  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 459 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.122843  normal  0.436579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3288  two component transcriptional regulator  35.85 
 
 		 272 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0970  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.86 
 
 		 459 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000694494  normal  0.524712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4608  two component transcriptional regulator  34.95 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4230  two component transcriptional regulator  34.95 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4296  two component transcriptional regulator  34.95 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0135013  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1027  response regulator receiver  38.61 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2004  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  34 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2788  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 474 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 508 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  33.33 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3419  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.61 
 
 		 475 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0592604  normal  0.514799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 509 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  33.96 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 417 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0330192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 391 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3895  two component Fis family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.88 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2940  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36 
 
 		 500 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1435  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37 
 
 		 498 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  31.82 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0403  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1351  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000171187  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  31.82 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 511 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1361  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 623 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  31.53 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4236  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.09 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.26 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.11 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  33.02 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.19 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1886  response regulator of RpoS  30.97 
 
 		 337 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0489347  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1880  response regulator of RpoS  30.97 
 
 		 337 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.239117  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1705  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 502 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1575  response regulator of RpoS  30.97 
 
 		 337 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.307447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1943  response regulator of RpoS  30.97 
 
 		 337 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.941531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1392  response regulator of RpoS  30.97 
 
 		 337 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  46.77 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  33.6 
 
 		 228 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3080  histidine kinase  36.07 
 
 		 1088 aa  57.8  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169759  normal  0.77184 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3019  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 455 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0178  response regulator receiver domain-containing protein  32.43 
 
 		 272 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  50.77 
 
 		 406 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.68 
 
 		 466 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  31.78 
 
 		 391 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0504  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 443 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  42.06 
 
 		 226 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0324  response regulator receiver domain-containing protein  34.71 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581793  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0816  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.58 
 
 		 233 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0636  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.621219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 250 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29000  sigma54-dependent response regulator, two-component  33.61 
 
 		 472 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.99042  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1438  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.58 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  33.04 
 
 		 516 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.86 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 639 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  31.58 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2361  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  31.58 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.18992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02106  hypothetical protein  31.58 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  31.58 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  43.66 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0549  response regulator receiver protein  28.07 
 
 		 119 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  43.66 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0632  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.03 
 
 		 254 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.85 
 
 		 240 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>