More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5193 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5193  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 313 aa  645    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6243  dihydrodipicolinate synthetase  75.24 
 
 		 322 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4593  dihydrodipicolinate synthetase  75.08 
 
 		 315 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.704885 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5759  dihydrodipicolinate synthetase  74.67 
 
 		 315 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6124  dihydrodipicolinate synthetase  74.67 
 
 		 315 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1385  dihydrodipicolinate synthetase  72.96 
 
 		 315 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1345  dihydrodipicolinate synthetase  73.29 
 
 		 315 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6606  dihydrodipicolinate synthetase  74.67 
 
 		 315 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573951 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7621  dihydrodipicolinate synthetase  74.01 
 
 		 314 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0301  dihydrodipicolinate synthetase  65.46 
 
 		 308 aa  421  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4125  dihydrodipicolinate synthetase  64.05 
 
 		 307 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3919  dihydrodipicolinate synthetase  46.3 
 
 		 314 aa  265  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3986  dihydrodipicolinate synthetase  34.8 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000446379  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6589  dihydrodipicolinate synthetase  34.56 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2814  dihydrodipicolinate synthetase  34.33 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  30.7 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  33.53 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  33.69 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  29.18 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  29.61 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  29.61 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  29.61 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  29.61 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  29.49 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  29.49 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  29.44 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  29.02 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  26.98 
 
 		 293 aa  86.3  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  33.89 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  30.39 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  29.22 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  29.09 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  29.46 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  28.64 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1864  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000003415  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1908  dihydrodipicolinate synthase  29.02 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0406  dihydrodipicolinate synthase family protein  26.2 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  29.02 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0349  dihydrodipicolinate synthase family protein  26.2 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  29.03 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  27.48 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  27.96 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  27.23 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  27.48 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  27.44 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  26.48 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  28.44 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  27.35 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  26.72 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  27.31 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  26.07 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  28.95 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  26.29 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  26.29 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  27.96 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  29.5 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  27.63 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  27.11 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  25.35 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  31.18 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  26.73 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  27.19 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  26.61 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  26.39 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  27.98 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  29.78 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  27.98 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  27.33 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  26.51 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  27.07 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  29.09 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  25.23 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  27.01 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  28.44 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  26.15 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  26.15 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>