276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2038 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  594  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3028  protein of unknown function DUF182  55.74 
 
 
255 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0481  hypothetical protein  50 
 
 
256 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0492  hypothetical protein  50 
 
 
256 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0503  hypothetical protein  50 
 
 
256 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10377  hypothetical protein  49.57 
 
 
251 aa  203  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000697611  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5288  protein of unknown function DUF182  50.97 
 
 
372 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2150  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  31.58 
 
 
353 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0035  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  33.14 
 
 
346 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.168888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0231  hypothetical protein  37.59 
 
 
299 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1376  hypothetical protein  32.96 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.403864 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  27.52 
 
 
295 aa  130  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2092  hypothetical protein  37.19 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  38.73 
 
 
345 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1215  protein of unknown function DUF182  40 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516897  normal  0.921927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1567  hypothetical protein  34.66 
 
 
297 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00460262  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1752  carbon monoxide dehydrogenase, coxF accessory protein  35 
 
 
271 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.348042 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1569  hypothetical protein  31.35 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106179  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  26.95 
 
 
265 aa  86.3  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  27.91 
 
 
541 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  27.91 
 
 
541 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  27.91 
 
 
541 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.91 
 
 
541 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.91 
 
 
541 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  27.91 
 
 
541 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.91 
 
 
541 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.52 
 
 
541 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  27.06 
 
 
249 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  28.74 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  24.6 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  34.97 
 
 
369 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  26.17 
 
 
526 aa  65.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  35.09 
 
 
380 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  27.84 
 
 
316 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  32.54 
 
 
307 aa  63.2  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  31.01 
 
 
356 aa  62.4  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  31.87 
 
 
353 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0061  hypothetical protein  25.57 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  30.72 
 
 
382 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  32.72 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  29.09 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  56.82 
 
 
783 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  30.54 
 
 
242 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  30 
 
 
231 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  27.11 
 
 
376 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  25.84 
 
 
281 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  25 
 
 
279 aa  59.7  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  28.31 
 
 
374 aa  59.7  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  56.82 
 
 
973 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  31.55 
 
 
386 aa  59.3  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  29.11 
 
 
234 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  33.53 
 
 
385 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  30.39 
 
 
372 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  30.27 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  32.5 
 
 
228 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  49.12 
 
 
908 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2142  heavy metal translocating P-type ATPase  49.12 
 
 
781 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000033244  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  30.15 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  35.37 
 
 
425 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  29.45 
 
 
354 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  28.49 
 
 
242 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  30.77 
 
 
242 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  27.86 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  28.42 
 
 
362 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1324  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.53 
 
 
255 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.996684 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  30.52 
 
 
235 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0253  xanthine dehydrogenase accessory factor  33.57 
 
 
260 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0909345  normal  0.275043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
895 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  28.21 
 
 
374 aa  56.2  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  54.55 
 
 
794 aa  55.8  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0679  protein of unknown function DUF182  28.18 
 
 
267 aa  55.8  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.350419  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  44 
 
 
804 aa  55.8  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  30.04 
 
 
368 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  31.45 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 
928 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  25.17 
 
 
325 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  31.61 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4203  hypothetical protein  35.07 
 
 
167 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  31.76 
 
 
373 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  29.28 
 
 
235 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  27.61 
 
 
344 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  39.77 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0087  heavy metal translocating P-type ATPase  48.15 
 
 
792 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.908745  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0132  YHS domain protein  50 
 
 
49 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  25 
 
 
389 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  33.54 
 
 
366 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  28.73 
 
 
389 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  44.19 
 
 
861 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  28.57 
 
 
240 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  48.94 
 
 
767 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  54.76 
 
 
765 aa  53.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1252  YHS domain-containing protein  58.14 
 
 
56 aa  53.9  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000672001 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  34.32 
 
 
390 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.57 
 
 
340 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  41.38 
 
 
793 aa  52.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  33.74 
 
 
368 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  48.98 
 
 
799 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.48 
 
 
345 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  44.9 
 
 
821 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  47.62 
 
 
805 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>