250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1215 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1215  protein of unknown function DUF182  100 
 
 		 270 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516897  normal  0.921927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1752  carbon monoxide dehydrogenase, coxF accessory protein  56.42 
 
 		 271 aa  258  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348042 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2092  hypothetical protein  50.95 
 
 		 256 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1567  hypothetical protein  43.46 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00460262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  45.66 
 
 		 345 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1569  hypothetical protein  38.28 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2150  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  37.5 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0035  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  37.21 
 
 		 346 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.168888 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  30.58 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  40 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0231  hypothetical protein  36.8 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1376  hypothetical protein  33.81 
 
 		 354 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.403864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3028  protein of unknown function DUF182  37.69 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  29.3 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  37.31 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10377  hypothetical protein  34.55 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000697611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.85 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0492  hypothetical protein  32.26 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0503  hypothetical protein  32.26 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0481  hypothetical protein  32.26 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5288  protein of unknown function DUF182  33.33 
 
 		 372 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  29.46 
 
 		 384 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  33.9 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  36.31 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  35 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  29.1 
 
 		 541 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  29.1 
 
 		 541 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.1 
 
 		 541 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.1 
 
 		 541 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  29.1 
 
 		 541 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.1 
 
 		 541 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  29.1 
 
 		 541 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.79 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  29.94 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.73 
 
 		 541 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  40.83 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  30.8 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  28.04 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  35.32 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  33.53 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  32.54 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.2 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  31.33 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  33.81 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  34.88 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  29.17 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  29.55 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  37.97 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  35.59 
 
 		 376 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  36.25 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.26 
 
 		 341 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.63 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  35.52 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  36.23 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  34.5 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.26 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  28.25 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  29.7 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  39.13 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  32 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  29.58 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  28.94 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  26.62 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  27.78 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  27.41 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  27.47 
 
 		 526 aa  72.4  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  31.61 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  33.76 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.29 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  35.61 
 
 		 242 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  28.96 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0061  hypothetical protein  32.69 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  36.02 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.22 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  29.03 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  32.37 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  29.07 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6767  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor XdhC/CoxF family-like protein  24.51 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  29.07 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0679  protein of unknown function DUF182  31.41 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.350419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  31.87 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  34.97 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  31.69 
 
 		 395 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  34.59 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  31.55 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  28.4 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  32.28 
 
 		 346 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  37.04 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  32.37 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0865  hypothetical protein  40.91 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000040151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  38.36 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  29.31 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  32.35 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0253  xanthine dehydrogenase accessory factor  31.58 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0909345  normal  0.275043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  33.54 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  36.57 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  40 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  31.28 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  27.9 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>