183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5288 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5288  protein of unknown function DUF182  100 
 
 		 372 aa  724    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  50.97 
 
 		 301 aa  206  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0492  hypothetical protein  51.87 
 
 		 256 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0503  hypothetical protein  51.87 
 
 		 256 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0481  hypothetical protein  51.87 
 
 		 256 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10377  hypothetical protein  46.94 
 
 		 251 aa  189  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000697611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3028  protein of unknown function DUF182  49.59 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1376  hypothetical protein  29.87 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.403864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0231  hypothetical protein  36.82 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2092  hypothetical protein  34.26 
 
 		 256 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1567  hypothetical protein  32.96 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00460262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2150  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  27.44 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  36.33 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1215  protein of unknown function DUF182  33.7 
 
 		 270 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516897  normal  0.921927 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0035  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  26.67 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.168888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1752  carbon monoxide dehydrogenase, coxF accessory protein  32.23 
 
 		 271 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348042 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  23.39 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1569  hypothetical protein  32.48 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106179  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  27.7 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  27.7 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  27.72 
 
 		 246 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  34.1 
 
 		 249 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  27.7 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.7 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  27.7 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.7 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.7 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.34 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  25 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0253  xanthine dehydrogenase accessory factor  36 
 
 		 260 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0909345  normal  0.275043 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  26.64 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  27.42 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  31.84 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0679  protein of unknown function DUF182  27.27 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.350419  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  31.79 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  52.83 
 
 		 799 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0132  YHS domain protein  46.81 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  58.54 
 
 		 973 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  27.75 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  31.03 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1324  xanthine dehydrogenase accessory factor  49.4 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.996684 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  57.14 
 
 		 809 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  36.42 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  33.73 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  36.96 
 
 		 351 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 818 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  39.36 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  54.76 
 
 		 806 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  24 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1872  YHS domain-containing protein  54.55 
 
 		 49 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0790  YHS domain-containing protein  47.73 
 
 		 48 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  48.94 
 
 		 801 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 794 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  31.74 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  27.61 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  52.27 
 
 		 783 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  34.62 
 
 		 861 aa  54.3  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2247  RND family efflux transporter MFP subunit  53.19 
 
 		 737 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  32.95 
 
 		 341 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  33.14 
 
 		 380 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  45.65 
 
 		 908 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  52.38 
 
 		 823 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  30.25 
 
 		 368 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0904  YHS domain-containing protein  50 
 
 		 47 aa  53.1  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  52.38 
 
 		 795 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 804 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 814 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  28.12 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  34.38 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 		 895 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  40.68 
 
 		 928 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 817 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 817 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  23.73 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  23.57 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  45.65 
 
 		 804 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  32.32 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  47.62 
 
 		 805 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  43.48 
 
 		 821 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  44.83 
 
 		 816 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  27.85 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  27.55 
 
 		 286 aa  50.8  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0674  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  37.21 
 
 		 186 aa  50.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  33.33 
 
 		 483 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0911  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 831 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  22.87 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  32.92 
 
 		 356 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  27.93 
 
 		 389 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  27.92 
 
 		 372 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  27.87 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  43.18 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0506  copper-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 807 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  31.48 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  30.18 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  25.15 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 787 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0311  copper-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 842 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.55 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  34.18 
 
 		 228 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  25.42 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>