261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0231 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0231  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  598  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1376  hypothetical protein  35.96 
 
 
354 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.403864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  45.23 
 
 
345 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  29.79 
 
 
295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  37.59 
 
 
301 aa  148  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2150  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  32.6 
 
 
353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2092  hypothetical protein  36.36 
 
 
256 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0035  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  32.58 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.168888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1752  carbon monoxide dehydrogenase, coxF accessory protein  36.15 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.348042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1215  protein of unknown function DUF182  36.4 
 
 
270 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516897  normal  0.921927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1567  hypothetical protein  35.42 
 
 
297 aa  115  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00460262  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5288  protein of unknown function DUF182  37.04 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3028  protein of unknown function DUF182  38.82 
 
 
255 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10377  hypothetical protein  35.34 
 
 
251 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000697611  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0492  hypothetical protein  36.16 
 
 
256 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0503  hypothetical protein  36.16 
 
 
256 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0481  hypothetical protein  36.16 
 
 
256 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  29.55 
 
 
265 aa  106  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1569  hypothetical protein  32.08 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106179  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  29.55 
 
 
246 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  36.69 
 
 
362 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  27.82 
 
 
281 aa  85.9  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  30.5 
 
 
249 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  30.95 
 
 
526 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  28.28 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  27.83 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  31.43 
 
 
244 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  27.84 
 
 
541 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  27.84 
 
 
541 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  25 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.84 
 
 
541 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.84 
 
 
541 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  27.84 
 
 
541 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.84 
 
 
541 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  27.84 
 
 
541 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.45 
 
 
541 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  30.18 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  30.25 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  26.09 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  29.96 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  32.18 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  28.89 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  28.2 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  30 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0679  protein of unknown function DUF182  30.86 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.350419  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  32.1 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0865  hypothetical protein  28.09 
 
 
375 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000040151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  30.43 
 
 
353 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  32.93 
 
 
372 aa  72.4  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  28.98 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  28.05 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  24.7 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  29.22 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  32.54 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  27.09 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  32.53 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  27.96 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  31.93 
 
 
341 aa  69.3  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  28.48 
 
 
382 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.26 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  27.78 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  27.78 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  31.03 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  27.78 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  30.3 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  26.11 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  29.48 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  25 
 
 
269 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  28.76 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  28.9 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  29.81 
 
 
372 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  30 
 
 
368 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  31.79 
 
 
370 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  29.63 
 
 
372 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  27.92 
 
 
380 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  31.9 
 
 
381 aa  63.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  32.69 
 
 
369 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0029  hypothetical protein  22.83 
 
 
278 aa  62.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180579  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  31.41 
 
 
388 aa  62.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  27.91 
 
 
357 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  33.56 
 
 
176 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  26.24 
 
 
374 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  33.77 
 
 
323 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  23.23 
 
 
279 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  31.25 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  33.12 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  27.54 
 
 
397 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  28.24 
 
 
368 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  26.29 
 
 
373 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  25.47 
 
 
379 aa  59.3  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  30.19 
 
 
230 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0253  xanthine dehydrogenase accessory factor  33.13 
 
 
260 aa  58.9  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0909345  normal  0.275043 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1324  xanthine dehydrogenase accessory factor  39.82 
 
 
255 aa  58.9  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.996684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2005  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  30.21 
 
 
109 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0215568  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  29.38 
 
 
389 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  29.22 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  31 
 
 
389 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.59 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  28.12 
 
 
382 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  31.21 
 
 
376 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>