262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1752 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1752  carbon monoxide dehydrogenase, coxF accessory protein  100 
 
 		 271 aa  534  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1215  protein of unknown function DUF182  56.42 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516897  normal  0.921927 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2092  hypothetical protein  51.33 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1567  hypothetical protein  41.73 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00460262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  44.87 
 
 		 345 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0035  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  36.19 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.168888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1569  hypothetical protein  38.29 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2150  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.9 
 
 		 353 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0231  hypothetical protein  36.15 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  35 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  36.47 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  28.99 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1376  hypothetical protein  35.91 
 
 		 354 aa  112  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.403864 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.61 
 
 		 249 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10377  hypothetical protein  34.62 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000697611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3028  protein of unknown function DUF182  33.83 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.0325485 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  25.97 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0481  hypothetical protein  35.36 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0492  hypothetical protein  35.36 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0503  hypothetical protein  35.36 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5288  protein of unknown function DUF182  31.85 
 
 		 372 aa  99.4  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  31.6 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.55 
 
 		 353 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  29.28 
 
 		 384 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  31.17 
 
 		 323 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  34.68 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  35.93 
 
 		 307 aa  89  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  28.36 
 
 		 367 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  33.78 
 
 		 306 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  28.67 
 
 		 342 aa  85.5  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  28.79 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  37.5 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  31.92 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  36.12 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  36.12 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  36.94 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  33.21 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  35.74 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  32.26 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  32.76 
 
 		 398 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  37.5 
 
 		 356 aa  82  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  32 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.22 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  27.38 
 
 		 541 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  27.38 
 
 		 541 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  27.38 
 
 		 541 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.38 
 
 		 541 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.38 
 
 		 541 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  29.8 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  27.38 
 
 		 541 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.38 
 
 		 541 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27 
 
 		 541 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  39.39 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  35 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  30.77 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  37.11 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.4 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0029  hypothetical protein  24.15 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  32.1 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  37.66 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  34.15 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  34.55 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  33.51 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  33.51 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  28.19 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  31.77 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  32.14 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  34.16 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  34.5 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  34.13 
 
 		 386 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  33.95 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  33.73 
 
 		 395 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  33.74 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  31.48 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  29.19 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  40.61 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  33.97 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  37.13 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  30.34 
 
 		 385 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  32.34 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  24.51 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  35.98 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  38.1 
 
 		 433 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  37.13 
 
 		 385 aa  72.4  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  34.05 
 
 		 370 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  31.37 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  26.56 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  32.26 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.52 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  38.26 
 
 		 176 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  28.05 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  35.52 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  27.53 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  38.22 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  35.5 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  33.33 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  36.7 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  28.25 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>