More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1081 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1081  histidine kinase  100 
 
 		 346 aa  718    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03370  signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 347 aa  261  8.999999999999999e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0118  sensor histidine kinase  37.24 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.151918  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1416  histidine kinase  39.07 
 
 		 342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0116  sensor histidine kinase  38.6 
 
 		 337 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0322042  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0837  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0398077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0831  sensor histidine kinase  36.66 
 
 		 336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0938177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5199  sensor histidine kinase  32.85 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2656  sensor protein YxdK  32.69 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2379  two-component sensor histidine kinase  32.36 
 
 		 334 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00984637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2539  histidine kinase  32.41 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2571  sensor protein YxdK  32.54 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.86964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2753  sensor histidine kinase  32.41 
 
 		 279 aa  166  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000130626 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2618  sensor histidine kinase, putative  32.36 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0136174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2344  sensor histidine kinase  32.36 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00230354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2323  histidine kinase  34.33 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0514446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2615  sensor histidine kinase  30.79 
 
 		 327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000946507 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4172  two-component sensor histidine kinase  29.1 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.420668  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 350 aa  159  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4284  histidine kinase  29.1 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.895654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2421  sensor histidine kinase, C-terminal  36.32 
 
 		 252 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208231  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0522  histidine kinase  32.13 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4183  sensor histidine kinase  28.81 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2176  histidine kinase  30.14 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4571  sensor histidine kinase  28.53 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4530  sensor histidine kinase  28.53 
 
 		 370 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4518  sensor histidine kinase  28.32 
 
 		 353 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0678  sensor histidine kinase  28.9 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1309  sensor histidine kinase  32.83 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000599634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4335  histidine kinase-like ATPase  28.1 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2305  histidine kinase  29.58 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000217968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  28.49 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  28.08 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  28.49 
 
 		 340 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  28.49 
 
 		 340 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  28.49 
 
 		 340 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3153  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  28.21 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4556  sensor histidine kinase  28.32 
 
 		 353 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0977  sensor histidine kinase  35.85 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0494  histidine kinase  27.46 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.752547  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1092  histidine kinase  32.53 
 
 		 303 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2205  sensor histidine kinase, putative  31.76 
 
 		 301 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2703  ATPase domain-containing protein  30.87 
 
 		 295 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2647  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 295 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 326 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1909  Signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0656  sensor histidine kinase, putative  30.95 
 
 		 357 aa  122  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0734197  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0835  Signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0874026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0698  ATPase domain-containing protein  30.45 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.541747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.132473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0313  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 932 aa  87.8  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 628 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  26.53 
 
 		 496 aa  80.5  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  26.34 
 
 		 1374 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 511 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  29.03 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  26.85 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1315  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.49 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  28.14 
 
 		 584 aa  77  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  28.67 
 
 		 751 aa  77  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  28.72 
 
 		 706 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 713 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  25.73 
 
 		 529 aa  76.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 500 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6726  histidine kinase  37.82 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 979 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 		 1271 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  32.12 
 
 		 923 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  25.64 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 705 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.37 
 
 		 597 aa  74.3  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 520 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  25.71 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 681 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  35.92 
 
 		 1064 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  27.16 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.58 
 
 		 1195 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  23.62 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 		 1936 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1926  histidine kinase  24.89 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>