More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0831 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0831  sensor histidine kinase  100 
 
 		 336 aa  671    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0938177  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0837  sensor histidine kinase  95.24 
 
 		 336 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0398077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0118  sensor histidine kinase  47.46 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.151918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0116  sensor histidine kinase  46.57 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0322042  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03370  signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 347 aa  264  1e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1416  histidine kinase  35.24 
 
 		 342 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1081  histidine kinase  36.66 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5199  sensor histidine kinase  34.51 
 
 		 341 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2323  histidine kinase  34.04 
 
 		 328 aa  179  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0514446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2539  histidine kinase  32.65 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0522  histidine kinase  32.08 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2753  sensor histidine kinase  33.21 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000130626 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  32.34 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  32.64 
 
 		 340 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  32.64 
 
 		 340 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  32.64 
 
 		 340 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  32.34 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  32.34 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  32.34 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2305  histidine kinase  34.63 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000217968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2656  sensor protein YxdK  33.22 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  32.34 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  32.34 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2571  sensor protein YxdK  32.86 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.86964  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2379  two-component sensor histidine kinase  32.29 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00984637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  32.34 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1309  sensor histidine kinase  40.28 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000599634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2344  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00230354  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2615  sensor histidine kinase  32.53 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000946507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2618  sensor histidine kinase, putative  32.53 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0136174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0494  histidine kinase  37.38 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.752547  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1092  histidine kinase  37.5 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2421  sensor histidine kinase, C-terminal  37.16 
 
 		 252 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4530  sensor histidine kinase  30 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4571  sensor histidine kinase  30 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2703  ATPase domain-containing protein  33.64 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2647  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4172  two-component sensor histidine kinase  29.44 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.420668  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4183  sensor histidine kinase  30.25 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4284  histidine kinase  34.04 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.895654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0678  sensor histidine kinase  36.6 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4556  sensor histidine kinase  34.89 
 
 		 353 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4518  sensor histidine kinase  34.04 
 
 		 353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4335  histidine kinase-like ATPase  33.62 
 
 		 321 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.132473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0698  ATPase domain-containing protein  30.3 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.541747  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0656  sensor histidine kinase, putative  33.18 
 
 		 357 aa  129  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0734197  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0835  Signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0874026  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3153  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2176  histidine kinase  25.72 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2205  sensor histidine kinase, putative  32.26 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1909  Signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0313  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0977  sensor histidine kinase  33.17 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 495 aa  95.9  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 465 aa  90.9  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  30.45 
 
 		 322 aa  89.4  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 608 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 599 aa  85.9  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.92 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  22.97 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 597 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.77 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2475  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 585 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  24.09 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.42 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.61 
 
 		 584 aa  79.7  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 597 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  22.52 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  26.91 
 
 		 575 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.69 
 
 		 680 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  23.61 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0109  histidine kinase  22.61 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000786251 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.52 
 
 		 581 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  26.43 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  24.66 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 590 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.01 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 585 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.65 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.76 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  21.82 
 
 		 455 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 		 489 aa  75.9  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 608 aa  75.9  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 511 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00510304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>