More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0313 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0313  sensor histidine kinase  100 
 
 
346 aa  706    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0698  ATPase domain-containing protein  69.65 
 
 
346 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.541747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.65 
 
 
346 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.132473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
334 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  30.61 
 
 
340 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  31 
 
 
340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  31 
 
 
340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  31 
 
 
340 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  31 
 
 
340 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  30.7 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  30.7 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  30.7 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  30 
 
 
340 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  30.4 
 
 
340 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
340 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2323  histidine kinase  30.37 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0514446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2656  sensor protein YxdK  29.97 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2344  sensor histidine kinase  29.5 
 
 
334 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00230354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2753  sensor histidine kinase  33.72 
 
 
279 aa  133  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130626 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2618  sensor histidine kinase, putative  29.66 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0136174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2571  sensor protein YxdK  33.6 
 
 
276 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.86964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2539  histidine kinase  29.88 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2379  two-component sensor histidine kinase  29.5 
 
 
334 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00984637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2615  sensor histidine kinase  29.36 
 
 
327 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000946507 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2305  histidine kinase  29.23 
 
 
328 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000217968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
343 aa  126  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0522  histidine kinase  30.28 
 
 
331 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0116  sensor histidine kinase  28.81 
 
 
337 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0322042  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1309  sensor histidine kinase  28.87 
 
 
323 aa  122  7e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000599634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2421  sensor histidine kinase, C-terminal  34.95 
 
 
252 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0118  sensor histidine kinase  28.76 
 
 
337 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.151918  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0837  sensor histidine kinase  30.77 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0398077  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03370  signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1416  histidine kinase  28.33 
 
 
342 aa  113  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122743  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0494  histidine kinase  25.38 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.752547  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
589 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1081  histidine kinase  30.36 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2176  histidine kinase  27.61 
 
 
368 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0831  sensor histidine kinase  30.13 
 
 
336 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0938177  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1092  histidine kinase  33.02 
 
 
303 aa  106  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2205  sensor histidine kinase, putative  32.6 
 
 
301 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
341 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0977  sensor histidine kinase  26.01 
 
 
312 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4518  sensor histidine kinase  27.72 
 
 
353 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
350 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  29.78 
 
 
257 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4172  two-component sensor histidine kinase  30.17 
 
 
370 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.420668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5199  sensor histidine kinase  26.49 
 
 
341 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0678  sensor histidine kinase  28.09 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238999  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
438 aa  97.4  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4335  histidine kinase-like ATPase  26.97 
 
 
321 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4530  sensor histidine kinase  25.35 
 
 
370 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4183  sensor histidine kinase  26.97 
 
 
370 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0656  sensor histidine kinase, putative  32.58 
 
 
357 aa  96.3  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0734197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4571  sensor histidine kinase  26.97 
 
 
360 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0835  Signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
331 aa  96.3  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0874026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2647  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4284  histidine kinase  26.39 
 
 
360 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.895654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2703  ATPase domain-containing protein  31.37 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3153  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
360 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4556  sensor histidine kinase  28.52 
 
 
353 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
350 aa  93.6  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
444 aa  91.3  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
639 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 
384 aa  89.4  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
525 aa  89.4  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
639 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  29.03 
 
 
397 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  27.27 
 
 
484 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  27.27 
 
 
436 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  27.27 
 
 
484 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  26.82 
 
 
483 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
639 aa  87  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
637 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  22.94 
 
 
369 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
418 aa  85.9  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
465 aa  86.3  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1435  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 
512 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1909  Signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 
291 aa  85.9  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
620 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2920  histidine kinase  28 
 
 
479 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
589 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
641 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
582 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0527  histidine kinase  27.8 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1617  histidine kinase  27.11 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
466 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0941  histidine kinase  29.28 
 
 
540 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.036916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24 
 
 
461 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1757  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 
614 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 
543 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0924  sensor histidine kinase; MrsK2 protein  25.81 
 
 
464 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 
436 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
621 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
534 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
445 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  26.48 
 
 
467 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.94 
 
 
531 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>