More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3333 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 350 aa  706    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0522  histidine kinase  49.24 
 
 		 331 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1309  sensor histidine kinase  38.7 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000599634  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0835  Signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0874026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2205  sensor histidine kinase, putative  34.01 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1092  histidine kinase  38.79 
 
 		 303 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5199  sensor histidine kinase  36.99 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0656  sensor histidine kinase, putative  40.27 
 
 		 357 aa  169  6e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0734197  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1909  Signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 291 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2703  ATPase domain-containing protein  32.48 
 
 		 295 aa  163  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2647  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 295 aa  163  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1081  histidine kinase  32.55 
 
 		 346 aa  159  7e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03370  signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2323  histidine kinase  31.89 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0514446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0118  sensor histidine kinase  37.14 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.151918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0116  sensor histidine kinase  37.14 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0322042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0494  histidine kinase  31.25 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.752547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2539  histidine kinase  31.38 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0977  sensor histidine kinase  31.33 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2618  sensor histidine kinase, putative  30.42 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0136174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2656  sensor protein YxdK  30.79 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0837  sensor histidine kinase  43.14 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0398077  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2379  two-component sensor histidine kinase  30.56 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00984637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2344  sensor histidine kinase  29.82 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00230354  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2615  sensor histidine kinase  30.79 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000946507 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2571  sensor protein YxdK  35.78 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.86964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2753  sensor histidine kinase  35.34 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000130626 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2176  histidine kinase  33.05 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0831  sensor histidine kinase  42.57 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0938177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2305  histidine kinase  30.09 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000217968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2421  sensor histidine kinase, C-terminal  35.81 
 
 		 252 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208231  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1416  histidine kinase  34.12 
 
 		 342 aa  129  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  28.79 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  28.79 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  28.79 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4518  sensor histidine kinase  27.83 
 
 		 353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  28.79 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  28.79 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  28.79 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  28.79 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  28.83 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  28.48 
 
 		 340 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  28.48 
 
 		 340 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4530  sensor histidine kinase  27.43 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4183  sensor histidine kinase  27.64 
 
 		 370 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4571  sensor histidine kinase  27.43 
 
 		 360 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0678  sensor histidine kinase  26.91 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238999  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4172  two-component sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.420668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4284  histidine kinase  27.07 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.895654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4556  sensor histidine kinase  27.19 
 
 		 353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3153  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4335  histidine kinase-like ATPase  28.34 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.132473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0698  ATPase domain-containing protein  28.57 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.541747  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0313  sensor histidine kinase  27.49 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  24.91 
 
 		 604 aa  83.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 470 aa  82.8  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.4 
 
 		 601 aa  83.2  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.05 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 610 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2761  histidine kinase  27.05 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.65 
 
 		 423 aa  79.3  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  24.15 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  23.81 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  23.81 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  23.81 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  23.81 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2179  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  23.81 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  23.81 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  23.81 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.9 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3739  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  28.76 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.9 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  25.98 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  31.36 
 
 		 464 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 461 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3153  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 587 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  28.88 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 1029 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0149  sensor histidine kinase/response regulator  26.58 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  24.7 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  35.66 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  35.66 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>