More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1309 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1309  sensor histidine kinase  100 
 
 
323 aa  649    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000599634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0522  histidine kinase  38.85 
 
 
331 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
350 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1092  histidine kinase  42.18 
 
 
303 aa  187  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1909  Signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0835  Signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
331 aa  179  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0874026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2205  sensor histidine kinase, putative  38.98 
 
 
301 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2647  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
295 aa  169  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2703  ATPase domain-containing protein  37.39 
 
 
295 aa  169  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5199  sensor histidine kinase  40.6 
 
 
341 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03370  signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
347 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0656  sensor histidine kinase, putative  37.5 
 
 
357 aa  159  6e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0734197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
343 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0116  sensor histidine kinase  37.78 
 
 
337 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0322042  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1416  histidine kinase  31.77 
 
 
342 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122743  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1081  histidine kinase  32.83 
 
 
346 aa  149  6e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  30.91 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  30 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  30.61 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  30.91 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  30.91 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  30.91 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  30.58 
 
 
340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0837  sensor histidine kinase  42.59 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0398077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  30.61 
 
 
340 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0118  sensor histidine kinase  37.33 
 
 
337 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.151918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  30.61 
 
 
340 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  30.61 
 
 
340 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0831  sensor histidine kinase  40.28 
 
 
336 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0938177  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0977  sensor histidine kinase  31.56 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
334 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2571  sensor protein YxdK  36.04 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.86964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
340 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2539  histidine kinase  31.71 
 
 
327 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2753  sensor histidine kinase  36.99 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130626 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2656  sensor protein YxdK  36.53 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2344  sensor histidine kinase  35.59 
 
 
334 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00230354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2379  two-component sensor histidine kinase  36.99 
 
 
334 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00984637  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2176  histidine kinase  33.33 
 
 
368 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2618  sensor histidine kinase, putative  35.62 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0136174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2421  sensor histidine kinase, C-terminal  35.94 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2615  sensor histidine kinase  36.53 
 
 
327 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000946507 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4518  sensor histidine kinase  32.64 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0494  histidine kinase  29 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.752547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2323  histidine kinase  32.65 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0514446  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2305  histidine kinase  29.58 
 
 
328 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000217968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4183  sensor histidine kinase  32.64 
 
 
370 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4530  sensor histidine kinase  32.22 
 
 
370 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4571  sensor histidine kinase  32.22 
 
 
360 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0698  ATPase domain-containing protein  28.4 
 
 
346 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.541747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
346 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.132473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4335  histidine kinase-like ATPase  33.48 
 
 
321 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0678  sensor histidine kinase  30.96 
 
 
353 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238999  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4172  two-component sensor histidine kinase  31.91 
 
 
370 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.420668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4556  sensor histidine kinase  32.22 
 
 
353 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4284  histidine kinase  29.96 
 
 
360 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.895654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0313  sensor histidine kinase  28.87 
 
 
346 aa  122  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3153  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
350 aa  94.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
421 aa  92.8  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 
880 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
597 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  28.44 
 
 
370 aa  84  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 
584 aa  83.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
607 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  27.27 
 
 
881 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24720  putative two-component sensor  29.11 
 
 
741 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
369 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  27.06 
 
 
423 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
477 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2094  virulence sensor protein BvgS  28.64 
 
 
691 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
600 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
1002 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
1002 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
487 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 
597 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
495 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
511 aa  76.6  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 
885 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  28.44 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 
467 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  24.85 
 
 
1071 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1285  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 
1070 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102629  normal  0.010179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
984 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3226  bacterioferritin  27.31 
 
 
696 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0988  histidine kinase  26.82 
 
 
486 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.638134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1562  histidine kinase  26.55 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  27.53 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1513  histidine kinase  26.55 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  26.4 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
1131 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  27.94 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  26.4 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 
466 aa  73.9  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
581 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  27.53 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>