More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2205 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2205  sensor histidine kinase, putative  100 
 
 
301 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2647  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.66 
 
 
295 aa  359  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2703  ATPase domain-containing protein  59.66 
 
 
295 aa  359  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1092  histidine kinase  42.38 
 
 
303 aa  229  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
350 aa  185  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1309  sensor histidine kinase  34.82 
 
 
323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000599634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0522  histidine kinase  32.06 
 
 
331 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0656  sensor histidine kinase, putative  40.1 
 
 
357 aa  155  7e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0734197  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0835  Signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
331 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0874026  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1909  Signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
291 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5199  sensor histidine kinase  30.88 
 
 
341 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1081  histidine kinase  31.9 
 
 
346 aa  129  6e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0118  sensor histidine kinase  32.5 
 
 
337 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.151918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4183  sensor histidine kinase  34.1 
 
 
370 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0116  sensor histidine kinase  32 
 
 
337 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0322042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0678  sensor histidine kinase  34.1 
 
 
353 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238999  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4530  sensor histidine kinase  34.1 
 
 
370 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4571  sensor histidine kinase  34.1 
 
 
360 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03370  signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 
347 aa  122  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4172  two-component sensor histidine kinase  34.1 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.420668  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0977  sensor histidine kinase  26 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4335  histidine kinase-like ATPase  33.18 
 
 
321 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4518  sensor histidine kinase  33.18 
 
 
353 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1416  histidine kinase  23.28 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122743  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4284  histidine kinase  33.18 
 
 
360 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.895654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3153  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
360 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4556  sensor histidine kinase  33.64 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2618  sensor histidine kinase, putative  31.6 
 
 
334 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0136174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2656  sensor protein YxdK  31.17 
 
 
327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  25.47 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
334 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2344  sensor histidine kinase  30.74 
 
 
334 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00230354  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 
340 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2379  two-component sensor histidine kinase  30.3 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00984637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  25.78 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0837  sensor histidine kinase  32.58 
 
 
336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0398077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  25.16 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  25.16 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  25.16 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  25.16 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  25.16 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  25.16 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2615  sensor histidine kinase  30.74 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000946507 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  25.16 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  25.08 
 
 
340 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2323  histidine kinase  29.56 
 
 
328 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0514446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2571  sensor protein YxdK  29.87 
 
 
276 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.86964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2421  sensor histidine kinase, C-terminal  30.19 
 
 
252 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208231  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0313  sensor histidine kinase  30.87 
 
 
346 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0494  histidine kinase  28.44 
 
 
340 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.752547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2753  sensor histidine kinase  29 
 
 
279 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130626 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2305  histidine kinase  27.94 
 
 
328 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000217968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0831  sensor histidine kinase  33.48 
 
 
336 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0938177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2539  histidine kinase  29 
 
 
327 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2176  histidine kinase  27.91 
 
 
368 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0698  ATPase domain-containing protein  28.1 
 
 
346 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.541747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
341 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
346 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.132473  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  27.04 
 
 
474 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  26.29 
 
 
474 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  26.29 
 
 
474 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  25.86 
 
 
474 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
451 aa  77  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  25.82 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  25.86 
 
 
474 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
451 aa  76.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2285  histidine kinase  24.49 
 
 
510 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000343872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 
608 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1149  histidine kinase  27.27 
 
 
471 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  26.43 
 
 
502 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
608 aa  73.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  24.78 
 
 
471 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  24.41 
 
 
455 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  24.41 
 
 
455 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
467 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3739  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  23.85 
 
 
379 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
595 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 
470 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
599 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  28.21 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11588  two-component sensor histidine kinase  29.2 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
468 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  37.8 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
463 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
590 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0941  histidine kinase  25.4 
 
 
540 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.036916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
455 aa  69.7  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  37.76 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  37.76 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 
584 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
429 aa  68.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
464 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
584 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2911  Signal transduction histidine kinase-like  27.44 
 
 
614 aa  68.9  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 
456 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  25.44 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>