280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2163 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2163  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
920 aa  1876    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.591838  normal  0.290265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  30.08 
 
 
393 aa  97.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  25.79 
 
 
557 aa  93.6  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  24.25 
 
 
831 aa  92.4  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  26.08 
 
 
489 aa  88.2  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  26.56 
 
 
684 aa  88.2  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  24.14 
 
 
961 aa  85.1  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  23.1 
 
 
1402 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.58 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 
1032 aa  77.4  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  25.05 
 
 
685 aa  75.5  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  28.02 
 
 
329 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.47 
 
 
380 aa  73.9  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  29.81 
 
 
235 aa  73.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  29.91 
 
 
464 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.63 
 
 
565 aa  72.8  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  31.55 
 
 
478 aa  72  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  22.39 
 
 
528 aa  71.6  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  29.55 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  23.24 
 
 
1037 aa  71.2  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 
346 aa  70.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 
976 aa  70.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.69 
 
 
392 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  24.62 
 
 
789 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  21.95 
 
 
1493 aa  69.3  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  32.89 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.95 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  40 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  39.39 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  32 
 
 
490 aa  67.4  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.05 
 
 
512 aa  67  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.23 
 
 
865 aa  67  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  40.48 
 
 
1086 aa  66.6  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  39.77 
 
 
1059 aa  65.5  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  27.06 
 
 
482 aa  65.5  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  32 
 
 
490 aa  65.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.75 
 
 
343 aa  65.1  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.76 
 
 
318 aa  65.1  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  31.94 
 
 
328 aa  64.7  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.59 
 
 
294 aa  64.3  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  44.59 
 
 
294 aa  64.3  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.63 
 
 
859 aa  63.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  27.93 
 
 
505 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  26.15 
 
 
327 aa  64.3  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  26.54 
 
 
285 aa  64.3  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.54 
 
 
325 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  29.11 
 
 
971 aa  63.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  28.48 
 
 
208 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  26.54 
 
 
325 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  35.11 
 
 
315 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.11 
 
 
971 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  37.35 
 
 
241 aa  62.4  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  28.32 
 
 
380 aa  62.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  24.9 
 
 
303 aa  62.8  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  31.25 
 
 
1105 aa  63.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58600  hypothetical protein  47.06 
 
 
271 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  37.86 
 
 
213 aa  62.4  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  37.24 
 
 
425 aa  62.4  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.63 
 
 
860 aa  62  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.67 
 
 
211 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.24 
 
 
487 aa  61.6  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  34.33 
 
 
307 aa  61.6  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  30.82 
 
 
415 aa  61.2  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  44.74 
 
 
115 aa  61.2  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  29.66 
 
 
245 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  29.05 
 
 
373 aa  60.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.26 
 
 
2413 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  29.61 
 
 
218 aa  60.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  25.77 
 
 
325 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
252 aa  60.8  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32.37 
 
 
254 aa  60.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  29.86 
 
 
838 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
705 aa  60.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  28.66 
 
 
399 aa  60.1  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  31.76 
 
 
416 aa  60.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  37.8 
 
 
373 aa  60.1  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  29.69 
 
 
1134 aa  60.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  35.71 
 
 
1160 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  43.04 
 
 
260 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.26 
 
 
270 aa  60.1  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  30.56 
 
 
329 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  27.6 
 
 
358 aa  59.7  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  22.54 
 
 
1430 aa  59.3  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.13 
 
 
223 aa  59.3  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0496  tetratricopeptide repeat family protein  34.91 
 
 
615 aa  59.3  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  41.33 
 
 
376 aa  58.9  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2933  tetratricopeptide TPR_2  28.21 
 
 
287 aa  58.9  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1129  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.1 
 
 
141 aa  59.3  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000041698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.53 
 
 
278 aa  58.5  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  36.79 
 
 
731 aa  58.5  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  39.73 
 
 
763 aa  58.5  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  33.6 
 
 
267 aa  58.2  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  28.65 
 
 
359 aa  58.2  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  46.58 
 
 
117 aa  58.2  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  39.73 
 
 
376 aa  57.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  35.71 
 
 
1105 aa  57.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
223 aa  57.8  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.97 
 
 
231 aa  57  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  29.23 
 
 
839 aa  57.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.25 
 
 
1110 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>