89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0547 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0547  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  343  5e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.115845  normal  0.111444 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.35 
 
 		 137 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.57 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  28.97 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.05 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  34.25 
 
 		 135 aa  47.8  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  34.33 
 
 		 132 aa  47.4  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.06 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  35.94 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.06 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  28.57 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  28.57 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  28.57 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  28.57 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  28.57 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.24 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.06 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1697  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.11 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.57 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.57 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.06 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.4 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.85 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  34.92 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.17 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.92 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.67 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45 
 
 		 133 aa  45.1  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  32.81 
 
 		 133 aa  44.7  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.35 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.89 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 139 aa  44.3  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.33 
 
 		 139 aa  44.3  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.218457 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  23.84 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.84 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.88 
 
 		 137 aa  44.3  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1239  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.09 
 
 		 148 aa  44.3  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.371549  normal  0.35298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.98 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.81 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  34.85 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.66 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.17 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.67 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1698  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.59 
 
 		 250 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0874  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.76 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.67 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2485  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.11 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000540401  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1012  TonB system transport protein  32.76 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  24 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.1 
 
 		 122 aa  42.4  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.11 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2484  putative TonB system transport protein ExbD2  34.67 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000778685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 134 aa  42  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4624  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.48 
 
 		 137 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000994253 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.97 
 
 		 139 aa  42  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5983  TonB system transport protein ExbD  25.9 
 
 		 155 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3233  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28 
 
 		 142 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 134 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 134 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.9 
 
 		 217 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.48 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0546  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00922706  normal  0.113975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  44.74 
 
 		 134 aa  41.2  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0813  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.17 
 
 		 136 aa  41.6  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 140 aa  41.2  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0871  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 135 aa  41.2  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.11 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  25.52 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  33.33 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.22 
 
 		 139 aa  40.8  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.65 
 
 		 138 aa  40.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 140 aa  40.8  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  53.33 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>