43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1697 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1697  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 173 aa  353  6.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.04 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1003  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.1 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0547  hypothetical protein  30.11 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.115845  normal  0.111444 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.66 
 
 		 140 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.84 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.63 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3345  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.65 
 
 		 134 aa  44.7  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.92 
 
 		 133 aa  44.3  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.02 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  58.06 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4373  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.58 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.25 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.51 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1428  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.61 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2017  hypothetical protein  32.89 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1698  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.93 
 
 		 250 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.97 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4069  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.78 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 140 aa  42  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4167  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.17 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  26.95 
 
 		 134 aa  42  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0550  hypothetical protein  26.53 
 
 		 177 aa  42  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  35.71 
 
 		 135 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2485  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.3 
 
 		 141 aa  42  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000540401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  51.35 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.17 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.95 
 
 		 134 aa  42  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.25 
 
 		 140 aa  42  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.53 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  28.33 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0452  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.48 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0324206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  28.32 
 
 		 133 aa  41.2  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6027  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 160 aa  41.2  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.4 
 
 		 140 aa  41.2  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.091049  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  28.33 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.946686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.12 
 
 		 136 aa  40.8  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.83 
 
 		 136 aa  40.8  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.27 
 
 		 155 aa  40.8  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>