66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1428 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1428  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 197 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1003  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.23 
 
 		 176 aa  194  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4057  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.62 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000796256  hitchhiker  0.000000255237 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0491  hypothetical protein  42.37 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46585  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.32 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00127684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.53 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3099  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.43 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422914  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2016  hypothetical protein  39.26 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2764  hypothetical protein  33.73 
 
 		 175 aa  101  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2763  hypothetical protein  36.42 
 
 		 174 aa  98.2  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.861823  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0731  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.97 
 
 		 174 aa  94.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.97 
 
 		 174 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 174 aa  88.6  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.946686  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  34.92 
 
 		 174 aa  85.1  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  32.61 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0590  hypothetical protein  32.2 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0635  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.73 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0551  hypothetical protein  26.71 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0589  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.29 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.768385  normal  0.646896 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0634  hypothetical protein  41.03 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0571  hypothetical protein  38.1 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.487342 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0730  hypothetical protein  43.08 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0604  hypothetical protein  45.16 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1962  hypothetical protein  43.55 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0548542  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1719  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.34 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00014535  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1587  hypothetical protein  39.44 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0550  hypothetical protein  26.28 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.93 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0492  hypothetical protein  39.47 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.717698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4069  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.43 
 
 		 135 aa  48.5  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2017  hypothetical protein  24.08 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.49 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00337979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.72 
 
 		 135 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4648  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.5 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.19 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  35.19 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  42.86 
 
 		 136 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.19 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.19 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.19 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.19 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.19 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.19 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.19 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.63 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.82 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.19 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.82 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 134 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  31.82 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.96 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 134 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.25 
 
 		 134 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1697  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  26.14 
 
 		 133 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.42 
 
 		 140 aa  42  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.34 
 
 		 141 aa  42.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 135 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1427  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.19 
 
 		 218 aa  42  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  22.46 
 
 		 134 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.57 
 
 		 137 aa  42  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.38 
 
 		 138 aa  41.6  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000374903  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.6 
 
 		 159 aa  41.6  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>