67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0491 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0491  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46585  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2764  hypothetical protein  58.24 
 
 		 175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2763  hypothetical protein  53.85 
 
 		 174 aa  179  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.861823  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.01 
 
 		 179 aa  144  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1428  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.5 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.19 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00127684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1003  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.22 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4057  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.28 
 
 		 193 aa  117  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000796256  hitchhiker  0.000000255237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3099  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.46 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422914  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2016  hypothetical protein  45.3 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  31.07 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0731  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.3 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.16 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0590  hypothetical protein  30.51 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0635  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.66 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4648  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.22 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  29.89 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.946686  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0571  hypothetical protein  34.62 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.487342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0589  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.62 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.768385  normal  0.646896 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0634  hypothetical protein  40 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0730  hypothetical protein  36.25 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0604  hypothetical protein  35 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1962  hypothetical protein  35 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0548542  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0551  hypothetical protein  26.8 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1587  hypothetical protein  35 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  24.68 
 
 		 136 aa  52  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.26 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00337979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.33 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0492  hypothetical protein  44.44 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.717698  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2017  hypothetical protein  44.44 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1719  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  22 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00014535  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.19 
 
 		 137 aa  48.5  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4056  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.31 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022799  hitchhiker  0.00000194913 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0550  hypothetical protein  36.84 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.31 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  33.33 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.82 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.21 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1427  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.64 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.56 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.23 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.93 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1303  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.64 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02760  hypothetical protein  30 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  21.52 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0780  hypothetical protein  24.66 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.65 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.56 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.4 
 
 		 135 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  31.11 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2485  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.43 
 
 		 141 aa  42  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000540401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 		 134 aa  42  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.71 
 
 		 140 aa  41.6  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  36.36 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  25.93 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.19 
 
 		 134 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.19 
 
 		 134 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.19 
 
 		 134 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  38.1 
 
 		 143 aa  41.2  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.19 
 
 		 134 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 122 aa  41.2  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>