22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2763 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2763  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  352  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.861823  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2764  hypothetical protein  59.66 
 
 
175 aa  193  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0491  hypothetical protein  53.57 
 
 
184 aa  177  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46585  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.13 
 
 
178 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00127684  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1428  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.42 
 
 
197 aa  98.2  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1003  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.14 
 
 
176 aa  97.4  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3099  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.12 
 
 
169 aa  97.4  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422914  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4057  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.68 
 
 
193 aa  97.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000796256  hitchhiker  0.000000255237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.71 
 
 
179 aa  97.4  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2016  hypothetical protein  32.72 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4648  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.14 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.07 
 
 
174 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  23.31 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0731  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.27 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0590  hypothetical protein  25.77 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  24.85 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0635  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.38 
 
 
182 aa  52  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.18 
 
 
174 aa  48.5  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.946686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.69 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0634  hypothetical protein  21.97 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  22.29 
 
 
136 aa  44.7  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0589  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.15 
 
 
177 aa  40.8  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.768385  normal  0.646896 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>