20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4648 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4648  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 193 aa  397  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00127684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0491  hypothetical protein  27.22 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46585  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2016  hypothetical protein  31.79 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2763  hypothetical protein  28.14 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.861823  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2764  hypothetical protein  29.17 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4057  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.22 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000796256  hitchhiker  0.000000255237 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  30.94 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.81 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.93 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3099  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.34 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422914  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1003  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.21 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.26 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.946686  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0731  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.17 
 
 		 174 aa  48.5  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0635  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.85 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1428  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.5 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  25.53 
 
 		 188 aa  44.7  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0590  hypothetical protein  25.53 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0634  hypothetical protein  38.98 
 
 		 177 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0550  hypothetical protein  33.78 
 
 		 177 aa  42  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>