58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1303 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1303  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 211 aa  437  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1427  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  66 
 
 		 218 aa  289  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.92 
 
 		 205 aa  145  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.32 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00337979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0492  hypothetical protein  36.89 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.717698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4056  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.38 
 
 		 204 aa  141  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022799  hitchhiker  0.00000194913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2017  hypothetical protein  37.75 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0634  hypothetical protein  34.48 
 
 		 177 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0571  hypothetical protein  34.5 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.487342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0589  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.5 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.768385  normal  0.646896 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1587  hypothetical protein  31.5 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0550  hypothetical protein  25.13 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1962  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0548542  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0730  hypothetical protein  28 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0604  hypothetical protein  27 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.08 
 
 		 133 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0551  hypothetical protein  31.08 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.14 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.21 
 
 		 135 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0635  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  38.71 
 
 		 135 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  26.32 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.42 
 
 		 136 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 134 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  28.87 
 
 		 133 aa  45.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.79 
 
 		 174 aa  45.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 134 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 134 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 140 aa  45.1  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  30.67 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  25 
 
 		 132 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.01 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  30.34 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  32.47 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.43 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.946686  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.56 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  29.41 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0590  hypothetical protein  29.41 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.28 
 
 		 134 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 134 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.38 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 134 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.9 
 
 		 134 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.85 
 
 		 136 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  29.33 
 
 		 134 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.51 
 
 		 122 aa  42.4  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  28.44 
 
 		 134 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0054  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.42 
 
 		 129 aa  42.4  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.67 
 
 		 134 aa  42.4  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4069  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45 
 
 		 135 aa  42  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  31.51 
 
 		 143 aa  41.6  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  33.78 
 
 		 174 aa  41.6  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  36.67 
 
 		 135 aa  41.2  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>