More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4211 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4211  single-strand binding protein  100 
 
 		 143 aa  296  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  46.85 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  38.98 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  38.3 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  43.64 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  36.92 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  38.98 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6500  single-strand binding protein  39.42 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  37.9 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6592  single-strand binding protein  39.42 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130329  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  35.48 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  47.5 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4276  single-strand binding protein  39.42 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.7148099999999997e-20  normal  0.751726 
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  43.37 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  43.37 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  43.37 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 167 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  40.7 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2263  single-strand binding protein  40.18 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000257141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  40.83 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  37.68 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  43.75 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  40.7 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  35.29 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  36.51 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  37.07 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  36.28 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  32.71 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  40.65 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  36.13 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  36.04 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0025  single-strand DNA-binding protein  40.54 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  40 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  33.79 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  34.75 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  34.15 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  38.89 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  43.75 
 
 		 172 aa  70.1  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  42.5 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  35.64 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  33.61 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  42.17 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  38.98 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  35.64 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  37.04 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  37.04 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  45.57 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  34.29 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  31.17 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 301 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  31.17 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  40.48 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  39.84 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  41.25 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  38.37 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  35.64 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  37.62 
 
 		 146 aa  67  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  41.25 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  35.64 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  36.05 
 
 		 167 aa  66.6  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  40.96 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  35.48 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  40.96 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  36.7 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  42.5 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  43.53 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  32.2 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  40.48 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  36.7 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  36.45 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  36.45 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  38.64 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  35.83 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  43.75 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  43.53 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>