More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0025 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0025  single-strand DNA-binding protein  100 
 
 		 146 aa  294  2e-79  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl081  single-stranded DNA-binding protein  52.6 
 
 		 151 aa  147  3e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.34874e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  45.79 
 
 		 164 aa  89.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 169 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 173 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 173 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 172 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 172 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  37.16 
 
 		 164 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 170 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 173 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 173 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 173 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 172 aa  87  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  45.19 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  39.66 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  39.66 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  38.66 
 
 		 169 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  33.99 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  33.99 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  33.99 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  33.99 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  40 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  33.09 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  33.56 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  39.81 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  39.81 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  34.48 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  38.83 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  38.83 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  38.83 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  34.93 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  33.8 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  39.22 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  35.66 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  34.33 
 
 		 185 aa  73.9  0.0000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 187 aa  73.6  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 		 172 aa  73.6  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  37.86 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  37.86 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  35.77 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  29.1 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  38.83 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  34.04 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  33.79 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4211  single-strand binding protein  40.54 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  34.4 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  36.11 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  38.26 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  39.8 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  39.8 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 180 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  36.7 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  36.89 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  33.33 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  36.89 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  36.89 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  33.59 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  35.19 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  38.83 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  35.64 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  35.64 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  36.89 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  34.86 
 
 		 140 aa  67  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1921  single-strand DNA binding protein  32.08 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.827601  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1639  single-strand binding protein family  31.13 
 
 		 109 aa  67  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.439521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  36.54 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  31.62 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  29.86 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  33.1 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  30.83 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  31.65 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  34.86 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  30.83 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  31.67 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  26.71 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  27.21 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  27.89 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  30.48 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  29.2 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>