More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6592 on replicon NC_008385
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6500  single-strand binding protein  100 
 
 		 113 aa  233  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157974  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6592  single-strand binding protein  100 
 
 		 113 aa  233  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130329  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4276  single-strand binding protein  88.29 
 
 		 112 aa  205  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.7148099999999997e-20  normal  0.751726 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2263  single-strand binding protein  61.95 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000257141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  38.74 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  39.29 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  39.29 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4211  single-strand binding protein  39.42 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  39.29 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  36.27 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  38.53 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1664  single-strand binding protein  45.24 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286469  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  32.43 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  34.95 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  40 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  37.17 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  34.34 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 185 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 185 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  35.58 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 183 aa  70.1  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 177 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 177 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  34.91 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  30.56 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  35.58 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  33.64 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  33.64 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  32.73 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  34.74 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1033  single-stranded DNA-binding protein  38.83 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.391899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  32.11 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  32.11 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  32.11 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  32.11 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  32.11 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  35.96 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  32.11 
 
 		 238 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  34.26 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  34.86 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  33.68 
 
 		 231 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  32.04 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  33.68 
 
 		 236 aa  67  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  33.68 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 173 aa  67  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 172 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  33.68 
 
 		 236 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  32.71 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  40.35 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4316  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  34.26 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  38.74 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  33.63 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  34.26 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  35.96 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  33.67 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  34.74 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  33.91 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0780  single-strand binding protein  41.46 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  35.96 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  34.69 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>