53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0896 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0896  hypothetical protein  100 
 
 		 656 aa  1330    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000365013  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  28.21 
 
 		 1014 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  24.03 
 
 		 441 aa  53.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  38.78 
 
 		 734 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  37.5 
 
 		 734 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2902  translocation protein TolB  42.86 
 
 		 428 aa  50.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000513444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1156  translocation protein TolB  42.86 
 
 		 428 aa  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  40.98 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  42.86 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  42.86 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  42.86 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  42.86 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  42.86 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  34.92 
 
 		 434 aa  49.7  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  40.98 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  40.98 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3087  translocation protein TolB  41.27 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000560471  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  39.34 
 
 		 430 aa  48.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0446  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 340 aa  47.8  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1249  translocation protein TolB  41.27 
 
 		 430 aa  47.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000163249  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0763  translocation protein TolB  41.27 
 
 		 431 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000112892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2915  translocation protein TolB  41.27 
 
 		 430 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000243248  normal  0.51862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0662  translocation protein TolB  41.27 
 
 		 430 aa  47.4  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000673794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0843  translocation protein TolB  41.27 
 
 		 430 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000968933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00689  hypothetical protein  41.27 
 
 		 430 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000219845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2895  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  41.27 
 
 		 430 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000023315  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00700  translocation protein TolB precursor  41.27 
 
 		 430 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000197077  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2883  transcriptional regulator domain-containing protein  38.89 
 
 		 716 aa  47.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.011265  hitchhiker  0.0000000742237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0769  translocation protein TolB  41.27 
 
 		 430 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000591343  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  30.16 
 
 		 1010 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1238  translocation protein TolB  39.68 
 
 		 430 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00586154  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 427 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3061  transcriptional regulator domain-containing protein  42.37 
 
 		 716 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0196528  hitchhiker  0.000417149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  27.08 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  27.1 
 
 		 1005 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  27.65 
 
 		 467 aa  46.2  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  33.9 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2965  transcriptional regulator domain-containing protein  36.67 
 
 		 716 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00199161  normal  0.0124128 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  25.32 
 
 		 450 aa  45.8  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  24.02 
 
 		 421 aa  45.8  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  41.67 
 
 		 976 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  25.49 
 
 		 642 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  27.2 
 
 		 430 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  25.16 
 
 		 427 aa  45.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  23.73 
 
 		 443 aa  45.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  32 
 
 		 629 aa  44.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.09 
 
 		 442 aa  44.3  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  33.78 
 
 		 1059 aa  44.3  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 444 aa  43.9  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  23.36 
 
 		 442 aa  43.9  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 444 aa  43.9  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  22.41 
 
 		 437 aa  43.9  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1312  TolB domain-containing protein  40.68 
 
 		 413 aa  43.9  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>