61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1935 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  100 
 
 		 1275 aa  250  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  100 
 
 		 1275 aa  250  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1935  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  244  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.774717  normal  0.50775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  31.48 
 
 		 1289 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  31.48 
 
 		 1289 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  31.48 
 
 		 1289 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  31.48 
 
 		 1289 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  29.36 
 
 		 1365 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  31.03 
 
 		 1348 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  30.84 
 
 		 1302 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  30.09 
 
 		 1332 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  30.84 
 
 		 1302 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  30.28 
 
 		 1365 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1369 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  30.09 
 
 		 1317 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  26.55 
 
 		 1329 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  32.73 
 
 		 1302 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  28.97 
 
 		 1199 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  29.36 
 
 		 1366 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  28.04 
 
 		 1268 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  31.15 
 
 		 1358 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1216  hypothetical protein  31.15 
 
 		 431 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0929  SciS protein  31.15 
 
 		 431 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  30.84 
 
 		 1211 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  29.91 
 
 		 1302 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  31.15 
 
 		 1358 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  29.91 
 
 		 1302 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  29.91 
 
 		 1302 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  31.15 
 
 		 1358 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  31.53 
 
 		 1187 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  28.7 
 
 		 1220 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  26.85 
 
 		 1164 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1164 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  27.1 
 
 		 1218 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  24.55 
 
 		 1175 aa  47.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1102 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1176 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1205 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  30.68 
 
 		 1212 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1167 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  39.34 
 
 		 1209 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  39.34 
 
 		 1209 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  39.34 
 
 		 1209 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  27.27 
 
 		 1164 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1167 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  39.34 
 
 		 1209 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1167 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  39.34 
 
 		 1209 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  39.34 
 
 		 1209 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  39.34 
 
 		 1209 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1167 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  35.59 
 
 		 1175 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1104 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1147 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0730  hypothetical protein  27.27 
 
 		 728 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000967191  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  27.1 
 
 		 1209 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  25.23 
 
 		 1209 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1175 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1208 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  28.7 
 
 		 1182 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1192 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>