214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2540 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2540  periplasmic binding protein  100 
 
 		 359 aa  732    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.501058  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2441  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  99.72 
 
 		 359 aa  730    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3183  ferric enterobactin ABC transporter ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  99.44 
 
 		 359 aa  728    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.197139 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0138  iron-siderophore ABC transporter, periplasmic binding protein  47.1 
 
 		 316 aa  309  5e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  46.05 
 
 		 353 aa  295  6e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  37.65 
 
 		 347 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  37.27 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  37.94 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3071  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  37.18 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  37.19 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  29.97 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  34.69 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  30.74 
 
 		 361 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  30.37 
 
 		 373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.34 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2580  periplasmic binding protein  31.71 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  32.78 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  31.33 
 
 		 354 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.22 
 
 		 383 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2317  periplasmic binding protein  31.56 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  33.55 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.11 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  33.22 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2175  periplasmic binding protein  31.48 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.038626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.13 
 
 		 347 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  30.48 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0428  periplasmic binding protein  30.34 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0856962  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  29.77 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  31.92 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.87 
 
 		 348 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  29.28 
 
 		 346 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  33.12 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  31.69 
 
 		 662 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.06 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  28.75 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  28.76 
 
 		 351 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.13 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  28.29 
 
 		 347 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  29.74 
 
 		 344 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  28.76 
 
 		 336 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  26.54 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  31.88 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  32.91 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  29.22 
 
 		 341 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  27.21 
 
 		 356 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0375  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  28.03 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0270  twin-arginine translocation pathway signal  28.9 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0280  periplasmic binding protein  28.9 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0260  periplasmic binding protein  28.9 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  28.75 
 
 		 359 aa  99.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2692  periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 349 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154596  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10269  periplasmic iron-transport lipoprotein  28.32 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.110209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4037  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0308  periplasmic binding protein  27.76 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2219  periplasmic binding protein  29.64 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0176424  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  25.59 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  29.07 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  27.98 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3759  periplasmic binding protein  26.62 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  26.78 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  26.78 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4018  periplasmic binding protein  24.08 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  27.87 
 
 		 300 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  34.38 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2749  periplasmic binding protein  22.04 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  24.75 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  27.98 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  30.92 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4867  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  24.34 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  24.41 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  24.41 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1328  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0133758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  25.27 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  24.17 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  24.41 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  27.57 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  24.88 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0151  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.91 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  24.09 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  23.29 
 
 		 348 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  23.38 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3422  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  28.8 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0919226  normal  0.3231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3034  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3052  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.5 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0494  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.5 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.5 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0643  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00559  iron-enterobactin transporter subunit  27.84 
 
 		 318 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  25.87 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1909  periplasmic binding protein  22.45 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.48 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  33.04 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  28.49 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0677  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>