More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1333 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  74.57 
 
 
472 aa  675    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  71.61 
 
 
472 aa  653    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  78.02 
 
 
474 aa  734    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  73.36 
 
 
476 aa  682    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  71.4 
 
 
480 aa  672    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  71.34 
 
 
481 aa  653    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  74.11 
 
 
502 aa  635    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  83.12 
 
 
500 aa  780    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  100 
 
 
484 aa  965    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  72.2 
 
 
486 aa  665    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  82.52 
 
 
471 aa  716    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  74.55 
 
 
479 aa  676    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  72.98 
 
 
463 aa  666    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  75.22 
 
 
476 aa  656    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  74.11 
 
 
470 aa  654    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  70.63 
 
 
465 aa  626  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  67.02 
 
 
490 aa  619  1e-176  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  70.28 
 
 
478 aa  614  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  65.14 
 
 
482 aa  617  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  60.99 
 
 
505 aa  600  1e-170  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  71.02 
 
 
495 aa  592  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  69.78 
 
 
485 aa  588  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  68.85 
 
 
470 aa  561  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  61.82 
 
 
470 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  63.39 
 
 
486 aa  552  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  67.54 
 
 
470 aa  554  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  68.7 
 
 
470 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  68.7 
 
 
470 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  68.19 
 
 
470 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  61.1 
 
 
482 aa  551  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  68.7 
 
 
470 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  61.61 
 
 
472 aa  545  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  60.95 
 
 
464 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  60.55 
 
 
511 aa  535  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  60.3 
 
 
472 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  58.96 
 
 
487 aa  530  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  58.75 
 
 
487 aa  503  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  60.74 
 
 
489 aa  502  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  53.94 
 
 
475 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  53.52 
 
 
488 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  55.89 
 
 
477 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  54.39 
 
 
480 aa  475  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  55.67 
 
 
477 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  52.21 
 
 
476 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  44.88 
 
 
459 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  47.49 
 
 
478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  43.68 
 
 
462 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  43.76 
 
 
462 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  46.12 
 
 
458 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  43.9 
 
 
462 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  43.68 
 
 
462 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  43.9 
 
 
463 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  46.52 
 
 
464 aa  393  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  43.68 
 
 
462 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  43.24 
 
 
461 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  44.69 
 
 
458 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  43.68 
 
 
462 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  48.7 
 
 
465 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  43.33 
 
 
463 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  47.95 
 
 
465 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  43.46 
 
 
462 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  47.79 
 
 
463 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  42.89 
 
 
458 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  43.68 
 
 
462 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  47.61 
 
 
466 aa  391  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  46.36 
 
 
463 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  43.68 
 
 
462 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  46.92 
 
 
463 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  47.1 
 
 
478 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  47.29 
 
 
471 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  47.58 
 
 
463 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  44.69 
 
 
458 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  47.36 
 
 
455 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  44.57 
 
 
467 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  47.14 
 
 
463 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  43.36 
 
 
458 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  46.34 
 
 
471 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  45.66 
 
 
467 aa  385  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  46.55 
 
 
471 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  44.12 
 
 
458 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  46.08 
 
 
441 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  44.57 
 
 
469 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  43.94 
 
 
468 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  43.81 
 
 
459 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  45.68 
 
 
456 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  47.97 
 
 
505 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  43.21 
 
 
466 aa  384  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  46.04 
 
 
473 aa  385  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2403  argininosuccinate lyase  48.91 
 
 
455 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4138  argininosuccinate lyase  48.23 
 
 
454 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  45.08 
 
 
466 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  45.81 
 
 
469 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  47.18 
 
 
467 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  45.5 
 
 
460 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  40.39 
 
 
466 aa  381  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  44.12 
 
 
458 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  46.29 
 
 
459 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  44.64 
 
 
467 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  45.05 
 
 
472 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  46.7 
 
 
475 aa  382  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>