More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1128 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  100 
 
 
266 aa  525  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2343  ABC transporter related  70.08 
 
 
245 aa  342  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  63.81 
 
 
271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1231  ABC transporter related  62.7 
 
 
252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.903047  normal  0.0835348 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
244 aa  308  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5577  ABC transporter-related protein  62.06 
 
 
255 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
244 aa  308  9e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 
244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 
244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 
244 aa  306  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  59.43 
 
 
244 aa  305  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 
244 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.43 
 
 
244 aa  305  6e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.43 
 
 
244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.43 
 
 
244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  58.2 
 
 
244 aa  299  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0791  ABC transporter related protein  64.54 
 
 
251 aa  298  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142657  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5324  ABC transporter related  62.75 
 
 
254 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.836598  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.88 
 
 
244 aa  294  1e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4943  ABC transporter related  62.35 
 
 
254 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5031  ABC transporter related  62.35 
 
 
254 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.25 
 
 
244 aa  290  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.06 
 
 
244 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5811  ABC transporter related  56.97 
 
 
268 aa  285  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306389  normal  0.349168 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  56.73 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  56.3 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  55.98 
 
 
260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  57.54 
 
 
260 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  57.89 
 
 
251 aa  279  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  57.72 
 
 
254 aa  279  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  52.24 
 
 
245 aa  278  4e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  53.06 
 
 
240 aa  279  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  59.36 
 
 
258 aa  278  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  58.37 
 
 
240 aa  278  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.84 
 
 
245 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  55.47 
 
 
244 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  56.3 
 
 
259 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  56.47 
 
 
263 aa  276  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  55.65 
 
 
243 aa  275  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  57.26 
 
 
243 aa  275  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  55.6 
 
 
273 aa  275  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 
240 aa  275  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  56.1 
 
 
266 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.02 
 
 
240 aa  275  7e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 
241 aa  275  8e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  53.88 
 
 
241 aa  275  8e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  53.88 
 
 
241 aa  275  8e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  55.16 
 
 
268 aa  275  8e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.32 
 
 
250 aa  274  9e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.32 
 
 
250 aa  274  9e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  53.06 
 
 
247 aa  274  9e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.32 
 
 
250 aa  274  9e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  57.32 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  50 
 
 
242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.2 
 
 
246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 
240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.32 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  55.06 
 
 
262 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  55.29 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  51.43 
 
 
240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  53.88 
 
 
241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  55.34 
 
 
254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  55.47 
 
 
266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.91 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  57.14 
 
 
243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.32 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  60 
 
 
243 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.29 
 
 
246 aa  273  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.58 
 
 
247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  55.51 
 
 
240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.24 
 
 
240 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.24 
 
 
240 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.24 
 
 
240 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.24 
 
 
240 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  58.5 
 
 
252 aa  272  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  58 
 
 
257 aa  271  6e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  53.56 
 
 
267 aa  271  6e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  53.06 
 
 
241 aa  271  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  53.47 
 
 
241 aa  271  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  53.47 
 
 
241 aa  271  7e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  54.18 
 
 
250 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.58 
 
 
247 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0210  polar amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 
249 aa  271  8.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.24 
 
 
240 aa  270  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  56.22 
 
 
253 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.29 
 
 
240 aa  270  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55.92 
 
 
242 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  52.65 
 
 
241 aa  270  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.51 
 
 
240 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2698  ABC transporter related  56.85 
 
 
264 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.66 
 
 
242 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 
240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  55.6 
 
 
256 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.84 
 
 
247 aa  270  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.84 
 
 
240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1038  ABC transporter related  57.72 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.841367  normal  0.084671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.91 
 
 
267 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  56.97 
 
 
248 aa  269  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.65 
 
 
249 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  53.06 
 
 
241 aa  268  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>