More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0880 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0880  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 338 aa  653    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05790  transcriptional regulator  67.44 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3025  transcriptional regulator, LacI family  58.58 
 
 		 347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  57.19 
 
 		 376 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  52.82 
 
 		 354 aa  318  7e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2719  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  48.18 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4417  transcriptional regulator, LacI family  49.56 
 
 		 351 aa  276  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6713  transcriptional regulator, LacI family  48.48 
 
 		 342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.781502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  49.39 
 
 		 338 aa  265  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  48.66 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1756  transcriptional regulator, LacI family  49.11 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3040  transcriptional regulator, LacI family  47.49 
 
 		 339 aa  255  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0426  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  49.4 
 
 		 366 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0802  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  47.18 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3109  transcriptional regulator, LacI family  45.16 
 
 		 337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4388  LacI family transcription regulator  46.15 
 
 		 329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4475  LacI family transcription regulator  46.15 
 
 		 329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4769  LacI family transcription regulator  46.15 
 
 		 329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6927  LacI family transcription regulator  47.32 
 
 		 345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3308  LacI family transcription regulator  43.71 
 
 		 346 aa  242  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2646  transcriptional regulator, LacI family  44.48 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2867  transcriptional regulator, LacI family  46.11 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0458283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2305  transcriptional regulator, LacI family  45.88 
 
 		 349 aa  229  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3698  transcriptional regulator, LacI family  43.75 
 
 		 337 aa  225  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375251  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1943  transcriptional regulator, LacI family  45.7 
 
 		 347 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29660  transcriptional regulator, LacI family  43.28 
 
 		 336 aa  215  7e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  35.76 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28330  transcriptional regulator  41.86 
 
 		 382 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 		 342 aa  196  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  35.12 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  36.01 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.42 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  35.8 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  38.49 
 
 		 347 aa  192  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  34.74 
 
 		 355 aa  192  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  38.44 
 
 		 357 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  34.63 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  36.07 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  30.63 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  34.82 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  38.74 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  31.12 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  35.52 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  35.76 
 
 		 381 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.03 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  31.12 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 		 349 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.12 
 
 		 353 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  36.39 
 
 		 346 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  39.27 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.03 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  37.13 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.82 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.54 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  31.42 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  32.12 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.3 
 
 		 335 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  33.23 
 
 		 335 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.93 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  35.08 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  34.93 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.13 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.33 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.32 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  33.43 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.53 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  34.59 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  36.8 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  32.42 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2954  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.67 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  35.4 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  33.63 
 
 		 338 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  34.37 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.8 
 
 		 353 aa  176  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.12 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  34.33 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 343 aa  176  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 343 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  32.22 
 
 		 332 aa  175  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 343 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 343 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  31.12 
 
 		 340 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  32.63 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4573  LacI family transcription regulator  37.54 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  34.34 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  36.72 
 
 		 329 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  34.51 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  36.66 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  31.91 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4253  LacI family transcription regulator  40.18 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  32.63 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  35.45 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  34.23 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>