81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5071 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  100 
 
 		 278 aa  568  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  47.43 
 
 		 275 aa  239  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  47.79 
 
 		 286 aa  238  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  38.02 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  35 
 
 		 269 aa  128  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  33.71 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  33.59 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  35.18 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  35.43 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  34.78 
 
 		 251 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  30.38 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  34.12 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  32.43 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  31.64 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  34.13 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  29.62 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  30.26 
 
 		 260 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  32.02 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  29.89 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  31.18 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  28.85 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  28.46 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  29.12 
 
 		 260 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  28.9 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  26.97 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  28.9 
 
 		 259 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  30.29 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  27.92 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  30.11 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  29.93 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  29.66 
 
 		 269 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  31.46 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  32.04 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  30.5 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  28.14 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  32.18 
 
 		 281 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  29.7 
 
 		 274 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  31.1 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  28.41 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  27.8 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  35.67 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  32.75 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  31.87 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  34.3 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  29.5 
 
 		 590 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  29.21 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  26.22 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  28.91 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  28.06 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  25.58 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  30.45 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  32.37 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  32.75 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  28.57 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  30.06 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  27.4 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  27.49 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  28.41 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  28.25 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  27.39 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  26.21 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  25.63 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  26.45 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  24.35 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  24.35 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  24.35 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  22.14 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  23.95 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  29.57 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  25.86 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  24.69 
 
 		 506 aa  50.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  33.54 
 
 		 542 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.62 
 
 		 214 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  30.14 
 
 		 667 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  27.59 
 
 		 663 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  30.97 
 
 		 673 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  24.7 
 
 		 524 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  28.25 
 
 		 521 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  28.85 
 
 		 650 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  27.93 
 
 		 523 aa  43.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>