254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3342 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
131 aa  271  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  81.25 
 
 
112 aa  197  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  68.75 
 
 
112 aa  174  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  73.96 
 
 
96 aa  160  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  44.55 
 
 
111 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  40.91 
 
 
111 aa  96.7  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  39.09 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  37.96 
 
 
110 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.25 
 
 
120 aa  87.8  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  41.75 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  40.2 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  36.61 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.91 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.91 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.53 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  37.5 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2198  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.62 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.1 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  33.65 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  31 
 
 
242 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4231  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  34.74 
 
 
291 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.68 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1194  biphenyl 2,3-dioxygenase ferredoxin subunit (BphA3)  34.31 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889683  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.59 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.63 
 
 
526 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  32.89 
 
 
270 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.74 
 
 
361 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.97 
 
 
361 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  29.41 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.41 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  29.41 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  29.41 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  29.41 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  29.41 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  29.41 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  32.67 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  29.41 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.18 
 
 
361 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.84 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.84 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32 
 
 
309 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.37 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2541  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.07 
 
 
506 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.44 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  29.89 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.56 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.06 
 
 
116 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5985  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  33.66 
 
 
105 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3350  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.41 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4570  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 
105 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0919723  hitchhiker  0.000210645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.47 
 
 
509 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 
105 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0844  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.41 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.33 
 
 
137 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.35 
 
 
513 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.63 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3982  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.99 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0367029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0173  Rieske (2Fe-2S) region  36.99 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  27.1 
 
 
270 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23360  assimilatory nitrite reductase, small subunit  26.42 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0534419  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  28.45 
 
 
118 aa  50.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0207  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  30 
 
 
105 aa  50.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7057  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.99 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250016  normal  0.403256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1282  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.62 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.580287  normal  0.705623 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1349  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.17 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.203828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3175  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.07 
 
 
506 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759164  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1503  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  35.62 
 
 
105 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  26.53 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1338  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  35.62 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872244  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2492  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.62 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1596  toluene-4-monooxygenase system protein C  31.68 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1103  Rieske (2Fe-2S) protein  35.62 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476425  normal  0.326175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  36.62 
 
 
353 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  26.53 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.61 
 
 
521 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.41 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.96 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.36 
 
 
518 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  30.36 
 
 
238 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4149  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.39 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0321  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  35.62 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.23021  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0597  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  35.62 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0893389  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1305  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.62 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.935545  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1232  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.62 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0970  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  35.62 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2675  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.94 
 
 
506 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148641  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  29.27 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  31.43 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6323  Rieske (2Fe-2S) region  28.92 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.62 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0795  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.55 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  35.62 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0130  Rieske (2Fe-2S) protein  30.1 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1970  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.67 
 
 
546 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>