209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2954 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 315 aa  649    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  74.15 
 
 		 295 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  73.49 
 
 		 300 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  75.93 
 
 		 295 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  72.64 
 
 		 299 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  68.25 
 
 		 310 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  69.73 
 
 		 303 aa  424  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  67.52 
 
 		 307 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  68.71 
 
 		 303 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  67.46 
 
 		 304 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  67.2 
 
 		 307 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  66.44 
 
 		 303 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  66.78 
 
 		 304 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  66.24 
 
 		 307 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  67.89 
 
 		 298 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  65.76 
 
 		 303 aa  408  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  66.33 
 
 		 303 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  66.33 
 
 		 290 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  65.41 
 
 		 304 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  66.67 
 
 		 318 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  65.44 
 
 		 301 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  71.91 
 
 		 299 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  67.12 
 
 		 304 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  59.39 
 
 		 300 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  58.5 
 
 		 307 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  54.79 
 
 		 304 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  53.58 
 
 		 310 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  53.51 
 
 		 303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  51.96 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  55.48 
 
 		 287 aa  311  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  56.8 
 
 		 286 aa  301  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  52.2 
 
 		 306 aa  296  4e-79  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  52.82 
 
 		 291 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  53.22 
 
 		 286 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  52.16 
 
 		 291 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  50.5 
 
 		 297 aa  285  5.999999999999999e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  51.5 
 
 		 291 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  49.67 
 
 		 286 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  43.52 
 
 		 282 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  43.42 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  47.65 
 
 		 292 aa  265  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  46.74 
 
 		 256 aa  261  8e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  45.7 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2369  coproporphyrinogen III oxidase  41.92 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  43.25 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  40.27 
 
 		 303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  43.19 
 
 		 305 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  41.83 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  41.31 
 
 		 348 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1294  coproporphyrinogen III oxidase  43.77 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  36.86 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  37.65 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2066  coproporphyrinogen III oxidase  43.24 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87254  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  42.07 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4240  coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1926  coproporphyrinogen III oxidase  41.9 
 
 		 362 aa  209  6e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.420304  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  40.88 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  40.88 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1154  coproporphyrinogen III oxidase  37.35 
 
 		 348 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  42.95 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  40.33 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  40.54 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  39.34 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17691  coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 		 342 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  41.53 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  39.6 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3261  coproporphyrinogen III oxidase  42.12 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.77176  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  42.42 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  41.14 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  42.42 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17891  coproporphyrinogen III oxidase  38.91 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  40.74 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0346  coproporphyrinogen III oxidase  42.07 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  40.74 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  40.74 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  42.42 
 
 		 306 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1299  coproporphyrinogen III oxidase  41.81 
 
 		 307 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 		 375 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0403  coproporphyrinogen III oxidase  41.59 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0775561  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2685  Coproporphyrinogen oxidase  44.16 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17731  coproporphyrinogen III oxidase  38.59 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.932235  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  40.94 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  40.4 
 
 		 323 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  37.82 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  42.11 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  41.2 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  39.12 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2092  Coproporphyrinogen oxidase  39.93 
 
 		 313 aa  202  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0593493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  40.86 
 
 		 303 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  42.37 
 
 		 327 aa  202  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  41.95 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  40.94 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  41.28 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1900  coproporphyrinogen III oxidase  41.21 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.646946  normal  0.321427 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  40.74 
 
 		 302 aa  202  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  41.95 
 
 		 323 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  41.95 
 
 		 323 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1674  coproporphyrinogen III oxidase  37.94 
 
 		 342 aa  201  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0469797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>