More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2133 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2133  patatin  100 
 
 		 410 aa  852    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  53.87 
 
 		 378 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  56.72 
 
 		 405 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  56.72 
 
 		 405 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  56.72 
 
 		 405 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  53.89 
 
 		 412 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  53.89 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  53.89 
 
 		 412 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  53.89 
 
 		 412 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  53.89 
 
 		 412 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  55.91 
 
 		 405 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  55.91 
 
 		 405 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  53.89 
 
 		 412 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  55.38 
 
 		 405 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  53.62 
 
 		 412 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  53.62 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  50.59 
 
 		 412 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  49.64 
 
 		 412 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  56.45 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  51.19 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  51.42 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  52.65 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  50.66 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  52.92 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  51.67 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  51.32 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  51.32 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  52.19 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  50.13 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  53.31 
 
 		 403 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  47.17 
 
 		 442 aa  363  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  49.6 
 
 		 429 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  49.46 
 
 		 377 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  49.61 
 
 		 391 aa  342  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  52.96 
 
 		 390 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  47.86 
 
 		 384 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  49.46 
 
 		 379 aa  338  8e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  48.4 
 
 		 390 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  47.22 
 
 		 378 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  46.56 
 
 		 384 aa  329  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  50.55 
 
 		 385 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  51.82 
 
 		 374 aa  325  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  47.13 
 
 		 382 aa  325  9e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  45.51 
 
 		 385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  43.87 
 
 		 399 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  41.4 
 
 		 387 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2237  hypothetical protein  40.93 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  40.66 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3431  patatin  44.22 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  40.17 
 
 		 387 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  40.16 
 
 		 400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  39.89 
 
 		 418 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  40.11 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  40.11 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  39.39 
 
 		 379 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  39.5 
 
 		 379 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  39.22 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  39.28 
 
 		 379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  37.13 
 
 		 399 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  39.56 
 
 		 382 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  38.19 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  37.54 
 
 		 358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  36.46 
 
 		 356 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  35.63 
 
 		 341 aa  216  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  35.43 
 
 		 341 aa  215  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.11 
 
 		 765 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  35.14 
 
 		 341 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.2 
 
 		 763 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  36.87 
 
 		 357 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  36.55 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.41 
 
 		 757 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.41 
 
 		 757 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.41 
 
 		 757 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.41 
 
 		 757 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.41 
 
 		 757 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.41 
 
 		 757 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.41 
 
 		 757 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  34.38 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  34.38 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  34.39 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.85 
 
 		 777 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.64 
 
 		 757 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  34.59 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  31.64 
 
 		 346 aa  107  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  29.87 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  31.25 
 
 		 348 aa  103  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  33.76 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  32.48 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  30.89 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  31.15 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  30.77 
 
 		 414 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  30.24 
 
 		 349 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  30 
 
 		 346 aa  94.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  29.89 
 
 		 355 aa  94.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  28.48 
 
 		 386 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  29.81 
 
 		 382 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  30.83 
 
 		 360 aa  93.2  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  28.85 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  29.39 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  30.2 
 
 		 340 aa  91.3  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>