153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0516 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  94.83 
 
 		 383 aa  109  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  96.36 
 
 		 814 aa  108  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  96.36 
 
 		 387 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  96.36 
 
 		 1083 aa  108  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  94.64 
 
 		 766 aa  107  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0486  hypothetical protein  74.36 
 
 		 100 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4550  hypothetical protein  92.98 
 
 		 952 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3462  hypothetical protein  76.92 
 
 		 100 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  96.36 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3614  hypothetical protein  91.67 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0599096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4187  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  94.55 
 
 		 721 aa  104  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.162597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4861  imidazole glycerol phosphate synthase, glutamine amidotransferase subunit  74.03 
 
 		 270 aa  104  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285943  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0653  hypothetical protein  96.36 
 
 		 108 aa  104  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  67.05 
 
 		 940 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  94.55 
 
 		 311 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.87 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  91.53 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  92.86 
 
 		 101 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3420  regulatory protein, DeoR  96.3 
 
 		 439 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.382426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4553  diaminopimelate epimerase  89.83 
 
 		 382 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3301  hypothetical protein  94.64 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  86.67 
 
 		 2200 aa  101  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1350  hypothetical protein  89.83 
 
 		 160 aa  101  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  57.32 
 
 		 94 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4462  hypothetical protein  75.34 
 
 		 167 aa  99.8  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00243841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  57.32 
 
 		 94 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0145  hypothetical protein  92.59 
 
 		 93 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2442  ABC transporter related  91.07 
 
 		 634 aa  99.8  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0403227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3056  hypothetical protein  94.44 
 
 		 94 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3585  hypothetical protein  94.44 
 
 		 95 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4827  hypothetical protein  87.93 
 
 		 382 aa  99.4  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0506  hypothetical protein  91.07 
 
 		 172 aa  99.4  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1191  hypothetical protein  92.59 
 
 		 108 aa  99  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2362  hypothetical protein  79.41 
 
 		 137 aa  99  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.409842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2843  hypothetical protein  92.73 
 
 		 260 aa  99  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00708177  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0759  hypothetical protein  89.47 
 
 		 80 aa  98.6  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0862  hypothetical protein  92.59 
 
 		 114 aa  99  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  92.59 
 
 		 383 aa  97.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3399  hypothetical protein  89.09 
 
 		 109 aa  96.7  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  90.74 
 
 		 166 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4091  hypothetical protein  94.34 
 
 		 87 aa  96.7  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0144  hypothetical protein  88.89 
 
 		 183 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0873838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0788  extracellular solute-binding protein  88.89 
 
 		 358 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00176914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1717  hypothetical protein  90.91 
 
 		 107 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.235337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2898  hypothetical protein  92.45 
 
 		 75 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0111524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4830  multi-sensor signal transduction histidine kinase  76.19 
 
 		 848 aa  93.2  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.508218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0406  hypothetical protein  87.27 
 
 		 373 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2085  hypothetical protein  90.57 
 
 		 82 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  87.27 
 
 		 297 aa  93.2  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4764  hypothetical protein  79.03 
 
 		 318 aa  92  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.966578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3581  hypothetical protein  87.04 
 
 		 106 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0121712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2430  hypothetical protein  85.19 
 
 		 93 aa  89.4  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5001  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  76.56 
 
 		 828 aa  88.6  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0327  hypothetical protein  84.91 
 
 		 113 aa  88.2  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4778  cobyric acid synthase CobQ  76.19 
 
 		 628 aa  88.2  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.316992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0904  alcohol dehydrogenase  54.72 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2008  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.31 
 
 		 833 aa  86.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.6 
 
 		 527 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  69.81 
 
 		 81 aa  85.5  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0118  hypothetical protein  83.33 
 
 		 120 aa  84  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.899916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4031  hypothetical protein  82 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.282109  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  52.7 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  57.97 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  77.55 
 
 		 389 aa  74.7  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.17 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4296  cobalamin synthesis protein, P47K  79.07 
 
 		 366 aa  65.5  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2944  hypothetical protein  49.49 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.234718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0763  hypothetical protein  67.8 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  54.72 
 
 		 82 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  51.85 
 
 		 81 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  73.91 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  52.83 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  50 
 
 		 79 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  55.56 
 
 		 92 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  56.86 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  58.9  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  50 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  54 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54.55 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3040  hypothetical protein  60.78 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.119269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  52.17 
 
 		 74 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  54.55 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  58.14 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  56 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  48.15 
 
 		 88 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.21 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1733  hypothetical protein  78.79 
 
 		 119 aa  52.4  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0450  hypothetical protein  71.05 
 
 		 171 aa  51.6  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  45.45 
 
 		 64 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2497  hypothetical protein  71.05 
 
 		 171 aa  51.6  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  35.71 
 
 		 110 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  35.71 
 
 		 110 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2411  hypothetical protein  86.21 
 
 		 125 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  55.81 
 
 		 74 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  55.81 
 
 		 70 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0868  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  82.76 
 
 		 332 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  79.41 
 
 		 365 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>