60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2497 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2497  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  337  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0450  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  337  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  88.33 
 
 
2474 aa  191  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3040  hypothetical protein  96.08 
 
 
368 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.119269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1348  hypothetical protein  83.64 
 
 
101 aa  92.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1733  hypothetical protein  88.24 
 
 
119 aa  88.6  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.29 
 
 
312 aa  62.8  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  87.88 
 
 
383 aa  61.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0486  hypothetical protein  66.67 
 
 
100 aa  60.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  75.61 
 
 
814 aa  60.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  66.67 
 
 
101 aa  59.7  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  87.5 
 
 
220 aa  58.2  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1350  hypothetical protein  82.86 
 
 
160 aa  58.2  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3399  hypothetical protein  81.82 
 
 
109 aa  57.8  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355088  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  87.1 
 
 
1083 aa  57.8  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  87.1 
 
 
766 aa  57.4  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  87.1 
 
 
387 aa  57.4  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3462  hypothetical protein  87.5 
 
 
100 aa  57.4  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4861  imidazole glycerol phosphate synthase, glutamine amidotransferase subunit  87.5 
 
 
270 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285943  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  46.99 
 
 
281 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  82.35 
 
 
2200 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2442  ABC transporter related  87.1 
 
 
634 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0403227  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4550  hypothetical protein  87.1 
 
 
952 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0145  hypothetical protein  86.67 
 
 
93 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  87.1 
 
 
311 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4553  diaminopimelate epimerase  87.1 
 
 
382 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3614  hypothetical protein  52.86 
 
 
256 aa  55.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0599096  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3420  regulatory protein, DeoR  87.1 
 
 
439 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.382426  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0406  hypothetical protein  59.26 
 
 
373 aa  55.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0653  hypothetical protein  87.1 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2843  hypothetical protein  87.1 
 
 
260 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00708177  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4187  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  83.87 
 
 
721 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.162597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0862  hypothetical protein  86.67 
 
 
114 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  76.47 
 
 
383 aa  55.5  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4462  hypothetical protein  63.83 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00243841  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1191  hypothetical protein  86.67 
 
 
108 aa  54.7  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  83.87 
 
 
940 aa  54.7  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3301  hypothetical protein  87.1 
 
 
178 aa  54.7  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4091  hypothetical protein  65.96 
 
 
87 aa  54.7  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459018  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2362  hypothetical protein  64.58 
 
 
137 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.409842  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  87.1 
 
 
297 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0506  hypothetical protein  59.65 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2898  hypothetical protein  73.68 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0111524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4827  hypothetical protein  83.87 
 
 
382 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  61.7 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3585  hypothetical protein  83.33 
 
 
95 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  71.05 
 
 
202 aa  51.6  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0759  hypothetical protein  61.7 
 
 
80 aa  51.2  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1717  hypothetical protein  78.12 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.235337  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3056  hypothetical protein  83.33 
 
 
94 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0788  extracellular solute-binding protein  85.71 
 
 
358 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00176914  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0144  hypothetical protein  80 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0873838  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2403  hypothetical protein  74.29 
 
 
121 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152355  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4310  hypothetical protein  46.84 
 
 
99 aa  48.5  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.27811  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3970  hypothetical protein  95.24 
 
 
98 aa  47.8  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.578313  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0327  hypothetical protein  76.67 
 
 
113 aa  47.8  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453061  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3581  hypothetical protein  84.62 
 
 
106 aa  44.7  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0121712  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2430  hypothetical protein  80.77 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2085  hypothetical protein  66.67 
 
 
82 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0118  hypothetical protein  80.77 
 
 
120 aa  40.8  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.899916  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>