More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6052 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 274 aa  534  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.82 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41 
 
 		 284 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.98 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 		 281 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.63 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.25 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.13 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  36.25 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  36.82 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121812  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  36.86 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  41.13 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0347556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  40.28 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0211  ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.98 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566245  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0202  ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  35.06 
 
 		 282 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  37.79 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 		 243 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0488  putative binding protein-dependent transport system, membrane component  39.48 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.970837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  35.04 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  38.21 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  36.87 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  36.87 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  36.87 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  36.87 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  38.21 
 
 		 250 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  37.8 
 
 		 250 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 		 251 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  37.8 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  37.8 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 257 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 		 273 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 257 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  38.68 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.41 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  37.4 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 		 270 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2545  binding-protein-dependent transport system protein  34.77 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240068  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.04587  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0528385  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3166  ABC transporter, inner membrane subunit  37.21 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.173855  normal  0.365472 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 		 254 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112586  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 		 268 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1643  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.19 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0353041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  32.23 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 		 275 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 		 272 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.56 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0906  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 		 244 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1076  ABC transporter-like protein  37.04 
 
 		 488 aa  138  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.276573 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  33.05 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.805205  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.5 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549296  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>