More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5810 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5810  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 327 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  36.2 
 
 		 334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.83 
 
 		 338 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  33.53 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  34.72 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 324 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  32.34 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  33.74 
 
 		 338 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  32.54 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  28.78 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  33.71 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  31.61 
 
 		 314 aa  110  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  31.6 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  38.79 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 437 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.4 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  43.4 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  43.4 
 
 		 374 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 343 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  32.21 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2581  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0339755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  30.27 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  31.64 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 336 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4876  AraC family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  30.12 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 341 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  29.97 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3120  AraC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 324 aa  99.4  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5148  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0642429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2164  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.0201995 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 344 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.74 
 
 		 344 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.74 
 
 		 344 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.74 
 
 		 344 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 317 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  29.18 
 
 		 316 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 344 aa  95.9  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>