More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5722 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5722  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 149 aa  302  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 149 aa  150  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  53.44 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 149 aa  147  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  52.71 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2097  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.08 
 
 		 150 aa  142  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 148 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0209  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 145 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.36 
 
 		 148 aa  140  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0417  3-dehydroquinate dehydratase  46.31 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.85 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.3 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  44.22 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 		 153 aa  136  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1633  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.83 
 
 		 139 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 		 153 aa  136  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.39 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.92 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  43.97 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  43.75 
 
 		 156 aa  133  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.64 
 
 		 184 aa  130  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.93 
 
 		 142 aa  130  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 151 aa  130  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  43.75 
 
 		 176 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3003  3-dehydroquinate dehydratase  43.97 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216438  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  44.06 
 
 		 157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  43.75 
 
 		 176 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  45 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  44.93 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3996  3-dehydroquinate dehydratase  43.75 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  42.55 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6025  3-dehydroquinate dehydratase  43.88 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212804  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.53 
 
 		 145 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4434  3-dehydroquinate dehydratase  42.86 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 		 150 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  43.88 
 
 		 149 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  44.2 
 
 		 150 aa  126  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  44.22 
 
 		 153 aa  126  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2690  3-dehydroquinate dehydratase  43.97 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.26 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2438  3-dehydroquinate dehydratase type II  47.59 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0996759  normal  0.483602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 207 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4497  3-dehydroquinate dehydratase  43.54 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81741  normal  0.381959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  44.85 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3363  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.64 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  47.3 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 207 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  42.36 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  46.05 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  45.65 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 207 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 193 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  42.36 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  45.8 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  43.38 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  45.99 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2471  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.14 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  45.99 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  41.01 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>