More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4838 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4838  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 370 aa  772    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2057  Luciferase-like monooxygenase  80.85 
 
 		 376 aa  619  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.0602749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1738  luciferase family protein  80.56 
 
 		 372 aa  617  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1075  Luciferase-like monooxygenase  80.74 
 
 		 376 aa  614  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.0331405 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1823  luciferase family protein  76.69 
 
 		 366 aa  607  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.463883  normal  0.116387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1157  bacterial luciferase family protein  76.9 
 
 		 383 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0999  luciferase  76.06 
 
 		 360 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.724404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01015  predicted monooxygenase  73.97 
 
 		 382 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2630  Luciferase-like monooxygenase  75.21 
 
 		 363 aa  589  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1127  putative monooxygenase rutA  73.97 
 
 		 393 aa  589  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1130  putative monooxygenase rutA  74.93 
 
 		 393 aa  588  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.69729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2583  luciferase family protein  73.97 
 
 		 363 aa  588  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2113  putative monooxygenase rutA  75.49 
 
 		 363 aa  589  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1249  putative monooxygenase rutA  73.97 
 
 		 363 aa  588  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01022  hypothetical protein  73.97 
 
 		 382 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1584  luciferase family protein  74.79 
 
 		 381 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1525  luciferase family protein  75.77 
 
 		 363 aa  575  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00760  putative enzyme  73.24 
 
 		 362 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3938  pyrimidine utilization protein A  70.99 
 
 		 356 aa  539  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252871  normal  0.0210815 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3982  luciferase family protein  67.61 
 
 		 354 aa  495  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1128  monooxygenase of the alternative pyrimidine degradation pathway  62.78 
 
 		 360 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7126  hypothetical protein  55.18 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4506  Luciferase-like, subgroup  36.31 
 
 		 364 aa  242  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  35.63 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.96 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  34.19 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  36.08 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2625  Luciferase-like monooxygenase  34.55 
 
 		 353 aa  212  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0284237  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4216  luciferase family protein  33.89 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1168  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.53 
 
 		 366 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.46 
 
 		 380 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  28.84 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  30.08 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  28.45 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  28.9 
 
 		 367 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  28.9 
 
 		 367 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  28.46 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  29.08 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  27.12 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  28.61 
 
 		 367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  28.61 
 
 		 367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  28.61 
 
 		 367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  28.05 
 
 		 378 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  27.73 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  27.76 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  29.89 
 
 		 353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  30.81 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 367 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  27.81 
 
 		 383 aa  126  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  27.44 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  27.44 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  27.61 
 
 		 367 aa  123  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  26.82 
 
 		 364 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  27 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  26.78 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  26.99 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  27.01 
 
 		 370 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  27.01 
 
 		 370 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4334  luciferase family protein  30.49 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.905772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  27.56 
 
 		 364 aa  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  26.72 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3199  bacterial luciferase family protein  28.65 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  26.23 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  25.85 
 
 		 363 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  26.26 
 
 		 366 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  25.85 
 
 		 363 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  30 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  30 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  25.7 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  28.29 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  27.32 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  29.73 
 
 		 395 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  26.29 
 
 		 385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  25.85 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0815  luciferase family protein  25 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  24.65 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  25.41 
 
 		 364 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  25.41 
 
 		 364 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  25.48 
 
 		 425 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  25.48 
 
 		 370 aa  109  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  25.41 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  27.55 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  26.92 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  25.82 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3065  luciferase  28.28 
 
 		 392 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0528805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1594  alkanesulfonate monooxygenase  32.84 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.481176 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6112  Luciferase-like monooxygenase  26.09 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  30.29 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4272  luciferase family protein  28.62 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2538  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  29.76 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.725321 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  27.75 
 
 		 352 aa  99.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4260  luciferase family protein  26.44 
 
 		 380 aa  99.4  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  28.82 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  24.93 
 
 		 403 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  26.92 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  25.7 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2634  alkanesulfonate monooxygenase  29.33 
 
 		 353 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00124194  hitchhiker  0.000000244107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  28.37 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0985  alkanesulfonate monooxygenase  28.57 
 
 		 353 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>