More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3855 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  100 
 
 		 437 aa  872    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  68.85 
 
 		 442 aa  588  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  65.61 
 
 		 448 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  67.82 
 
 		 437 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  66.35 
 
 		 428 aa  557  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  59.21 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  57.11 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  51.6 
 
 		 443 aa  442  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  53.61 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  50.94 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  52.21 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  51.08 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  52.4 
 
 		 437 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  51.8 
 
 		 438 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  52.22 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  50.82 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  49.89 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  52.8 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  51.8 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  50 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  48.95 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  47.07 
 
 		 439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  47.03 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  47.24 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  47.21 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  50 
 
 		 445 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  42.11 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  39.16 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  42.72 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  37.84 
 
 		 440 aa  299  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  41.08 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  39.54 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  37.47 
 
 		 447 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  37.21 
 
 		 436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  39.86 
 
 		 439 aa  286  4e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  40.05 
 
 		 436 aa  286  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  42.86 
 
 		 435 aa  285  8e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  40.37 
 
 		 439 aa  285  9e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  40.37 
 
 		 439 aa  285  9e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  38.53 
 
 		 443 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  38.53 
 
 		 443 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  40.6 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  38.32 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  35.7 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  38.03 
 
 		 432 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  36.21 
 
 		 433 aa  269  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  39.26 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  36.95 
 
 		 424 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  37.18 
 
 		 424 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  37.3 
 
 		 446 aa  263  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  37.02 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  33.95 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  36.07 
 
 		 428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  34.88 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  36.6 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  34.52 
 
 		 417 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  36.58 
 
 		 430 aa  256  5e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  37.91 
 
 		 466 aa  256  6e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  36.84 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  33.97 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  36.91 
 
 		 436 aa  254  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  37.56 
 
 		 429 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  33.88 
 
 		 432 aa  253  5.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  36.77 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  36.3 
 
 		 429 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  33.73 
 
 		 430 aa  250  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  35.35 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  37.41 
 
 		 425 aa  245  9e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  36.73 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  34.5 
 
 		 443 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  31.28 
 
 		 447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  34.43 
 
 		 438 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  39.11 
 
 		 434 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  31.81 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  34.99 
 
 		 465 aa  236  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  36.38 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  37.12 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  33.95 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  34.44 
 
 		 447 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  31.16 
 
 		 443 aa  233  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  31.16 
 
 		 443 aa  233  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  29.77 
 
 		 441 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  30.34 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  30.34 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  30.37 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  30.34 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  30.34 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  30.84 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  30.34 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  30.34 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  30.34 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  30.34 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  30.34 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  30.93 
 
 		 443 aa  231  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  30.68 
 
 		 447 aa  230  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  36.24 
 
 		 438 aa  229  8e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  30.61 
 
 		 447 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  36.34 
 
 		 431 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  30.14 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  30.61 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>