More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3576 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  663    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  66.55 
 
 		 316 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  62.42 
 
 		 329 aa  417  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  60.27 
 
 		 328 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5792  hypothetical protein  60.07 
 
 		 326 aa  363  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4082  hypothetical protein  52.23 
 
 		 291 aa  308  9e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  42.91 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  35.83 
 
 		 327 aa  202  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  37.85 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  36.75 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  37.19 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  36.12 
 
 		 355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  37.19 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  36 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0286  hypothetical protein  35.03 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  36.67 
 
 		 329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  36.3 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  37.58 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  35.27 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  35.98 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  37.91 
 
 		 329 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.55 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.55 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  37.87 
 
 		 331 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1838  hypothetical protein  33.73 
 
 		 330 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5978  hypothetical protein  35 
 
 		 327 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665972  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3194  hypothetical protein  36.52 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195792  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  36.36 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.8 
 
 		 327 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  35.62 
 
 		 328 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  34.93 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  34.69 
 
 		 333 aa  185  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  32.71 
 
 		 321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  36.7 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  33.96 
 
 		 327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1766  twin-arginine translocation pathway signal  34.83 
 
 		 338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  32.49 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  35.08 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  34.57 
 
 		 328 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  35.96 
 
 		 329 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36.33 
 
 		 339 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  34.76 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  35.51 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  34.71 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  32.4 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4540  hypothetical protein  35.38 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5514  hypothetical protein  34.88 
 
 		 330 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  35.76 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  35.19 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  33.33 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  32.29 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.91 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  34.59 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  34.15 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  34.35 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  34.59 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  34.25 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  33.56 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  34.47 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  32.9 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  36.62 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  34.46 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  33.55 
 
 		 328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  37.46 
 
 		 698 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  34.25 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  32.83 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  34.36 
 
 		 323 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  34.47 
 
 		 322 aa  172  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  35.05 
 
 		 323 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  33.12 
 
 		 346 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.44 
 
 		 328 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  34.16 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4265  hypothetical protein  34.81 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  34.47 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36.46 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  34.78 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  33.22 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  33.02 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  37.63 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  34.93 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.46 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  33.79 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  35.14 
 
 		 318 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  34.72 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  31.17 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2013  hypothetical protein  35.1 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  32.22 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  34.31 
 
 		 324 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  32.41 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  32.41 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  32.34 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  34.14 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  34.78 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  32.21 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0840  hypothetical protein  32.41 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  35.4 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  33.45 
 
 		 332 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  35.46 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>