259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_39 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011311  VSAL_p840_39  putative lipoprotein  100 
 
 		 355 aa  743    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0742904  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1793  hypothetical protein  68.38 
 
 		 354 aa  478  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.638173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4493  hypothetical protein  35.76 
 
 		 330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04702  lipoprotein, putative  32.61 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04714  lipoprotein, putative  29.54 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05513  Sulfatase modifying factor 1 precursor-like protein (C-alpha-formyglycine-generating enzyme 1)  28.7 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04718  lipoprotein, putative  32.21 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0504656  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2148  hypothetical protein  29.81 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0453912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  26.12 
 
 		 279 aa  95.9  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  26.94 
 
 		 276 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  25.39 
 
 		 398 aa  86.3  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  24.51 
 
 		 611 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  24.92 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  36.09 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  31.14 
 
 		 952 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  24.46 
 
 		 517 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  23.77 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  25.45 
 
 		 829 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  24.73 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  24 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  32.87 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  26.48 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  27.34 
 
 		 742 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  31.94 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  26.94 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 		 639 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  23.46 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 		 639 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  31.25 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  27.49 
 
 		 668 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1581 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  24.55 
 
 		 826 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  30.17 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  32.43 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  26.92 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  24.8 
 
 		 751 aa  72  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  29.91 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  25.85 
 
 		 522 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  25.1 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  25.66 
 
 		 527 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  30 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  27.04 
 
 		 922 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  35.25 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  25.42 
 
 		 517 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 618 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 		 637 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1196 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  33.33 
 
 		 802 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  27.06 
 
 		 862 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  25.11 
 
 		 497 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  27.17 
 
 		 538 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  27.38 
 
 		 892 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  25.95 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  25 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 		 620 aa  66.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  30.47 
 
 		 413 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.86 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  25.22 
 
 		 654 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  31.67 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  25.59 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.1 
 
 		 1183 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  29.59 
 
 		 523 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 510 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 		 882 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  25.97 
 
 		 616 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  25.77 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  25.85 
 
 		 551 aa  63.2  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  27.65 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.09 
 
 		 820 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  32.43 
 
 		 925 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  23.08 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 		 623 aa  62.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  29.53 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  32.69 
 
 		 614 aa  62.8  0.000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 593 aa  62.8  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  25.76 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1911 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  30.89 
 
 		 603 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  25 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  34.85 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  28.9 
 
 		 277 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  29.3 
 
 		 251 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  34.43 
 
 		 1049 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  26.32 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.05 
 
 		 1041 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 621 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  25.38 
 
 		 637 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 617 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  26.39 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3794  hypothetical protein  27.78 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000288368  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  28.68 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  28.47 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  26.24 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  30.36 
 
 		 692 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  31.54 
 
 		 664 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  32.52 
 
 		 657 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  37.5 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.37 
 
 		 1023 aa  60.1  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  27.75 
 
 		 929 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>