More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0690 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  100 
 
 
437 aa  902    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  67.71 
 
 
425 aa  611  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000617  glycosyltransferase  64.11 
 
 
424 aa  571  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.786644  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3535  glycosyl transferase family protein  51.92 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0420  glycosyl transferase family protein  51.92 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4179  glycosyl transferase, group 2 family protein  54.7 
 
 
403 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0448  glycosyl transferase family protein  53.05 
 
 
443 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  43.4 
 
 
450 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  44.74 
 
 
441 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
423 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 
479 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
423 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
479 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  32.25 
 
 
479 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  28.82 
 
 
752 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  28.8 
 
 
433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 
1124 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  31.2 
 
 
412 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  28.87 
 
 
1099 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
509 aa  116  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 
1101 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
477 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 
1154 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
450 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  25.14 
 
 
442 aa  113  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  27.1 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  27.1 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  30.56 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  30.28 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  30.28 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  25.41 
 
 
872 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  30.28 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  30.28 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  24.86 
 
 
442 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
464 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25.41 
 
 
927 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  30.28 
 
 
412 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  25.41 
 
 
1115 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  25.41 
 
 
1119 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.41 
 
 
1115 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  26.12 
 
 
418 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
484 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.93 
 
 
1002 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
469 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  25.84 
 
 
421 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.19 
 
 
1115 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  28.27 
 
 
451 aa  107  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.18 
 
 
1115 aa  106  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.18 
 
 
1120 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  25.84 
 
 
421 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  26.56 
 
 
421 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 
475 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
445 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 
549 aa  103  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
445 aa  103  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1815  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 
467 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
483 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  28.92 
 
 
461 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  25.32 
 
 
444 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  25.32 
 
 
444 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
637 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  26.65 
 
 
428 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  25.32 
 
 
444 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  24.8 
 
 
417 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  29.88 
 
 
403 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  28.11 
 
 
418 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1454  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.21 
 
 
472 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  26.28 
 
 
452 aa  97.8  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  23.24 
 
 
422 aa  97.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 
1118 aa  97.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
466 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0149  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.31 
 
 
397 aa  96.3  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.15168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
464 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6186  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
426 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
466 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4027  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 
484 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2254  glycosyl transferase family 2  23.63 
 
 
486 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1569  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 
475 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
410 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  25 
 
 
425 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  25 
 
 
425 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
395 aa  90.1  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  24.7 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3830  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7721  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
445 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.17 
 
 
422 aa  88.2  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  23.74 
 
 
1184 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 
789 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 
789 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 
789 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  25.07 
 
 
411 aa  87  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
648 aa  86.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
387 aa  86.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 
632 aa  84.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
393 aa  84  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5038  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
426 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>